Решение о регистрации выдано: Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций. ЭЛ № ФС 77 - 68501, от 27 января 2017.
Live and bio-abiotic systems
Живые и биокосные системы логотип
ISSN 2308-9709 (Online)
Научное электронное периодическое издание
Южного федерального университета.
ЮФУ
РУС ENG
  • Главная
  • О журнале
    • Публикационная этика
    • Редакционная коллегия
    • Положение о рецензировании
  • Архив
  • Авторы
  • Контакты
  • Условия публикации
Подать статью
  • Главная
  • О журнале
    • Публикационная этика
    • Редакционная коллегия
    • Положение о рецензировании
  • Архив
  • Авторы
  • Контакты
  • Условия публикации
Подать статью
РУС ENG
  1. Архив
  2. Выпуск №48
Обложка журнала Живые и биокосные системы Выпуск №48
Рубрики номера:
1.5.7. Генетика 1.5.9. Ботаника 1.5.15. Экология

Выпуск №48 июль 2024

  1. Эколого-биологические особенности сои северного экотипа в условиях средней тайги Западной Сибири (г. Сургут)
    Бордей Р. Х. Моисеева Е. А. Ложкина-Гамецкая Н. И.
    Резюме Abstract | Скачать
    58.02:58.084:58.084.5
    В статье представлены результаты изучения эколого-биологических особенностей сои северного экотипа в условиях средней тайги Западной Сибири (г. Сургут). Впервые проведена сравнительная оценка биологических особенностей сои сорта ‘СК Артика’, выявлены особенности онтогенеза и биоморфологические признаки, приведены результаты кормовой оценки и продуктивности, установлена возможность возделывания сои на корм в экстремальных почвенно-климатических условиях ХМАО-Югры. Материалы и методы. Исследования по изучению оценки биологических особенностей сои сорта ‘СК Артика’ проводились на базе ботанического сада Сургутского государственного университета ХМАО-Югры. Объектом изучения является однолетняя бобовая культура соя (сорт ‘СК Артика’). Результаты. В ходе интродукционного исследования установлено, что за счёт удлинения виргинильного периода интродуцента отмечен высокий сбор зелёной массы. Высота стеблестоя интродуцента и урожайность существенно не отличались от аналогичных, изучаемых показателей сортов сои северного экотипа, возделываемых в почвенно-климатических условиях г. Брянска. Зафиксировано, что за вегетационный период наступление генеративной фазы проходит при более низкой сумме активных температур воздуха (763 ℃), в отличие от г Брянска (2150–2300 ℃). Однако при этом наблюдается выпадение фазы периода восковой и полной спелости бобов.
    10.18522/2308-9709-2024-48-6
    The article presents the results of studying the ecological and biological features of soybeans of the northern ecotype in the conditions of the middle taiga of Western Siberia (Surgut). For the first time, a comparative assessment of the biological characteristics of soybeans of the SK Artika variety was carried out, the features of ontogenesis and biomorphological signs were revealed, the results of feed assessment and productivity were presented, the possibility of cultivating soybeans for feed in extreme soil and climatic conditions of the Khanty-Mansiysk Autonomous Okrug was established. Materials and methods. Studies on the assessment of the biological characteristics of soybeans of the ‘SK Artika’ variety were conducted on the basis of the Botanical Garden of the Surgut State University of the Khanty-Mansiysk Autonomous Okrug. The object of study is an annual soybean bean crop, a variety of ‘SK Artika’. Results. As a result of the introduction study, it was found that due to the lengthening of the virginal period of the introducer, a high collection of green mass was noted. The height of the introduced stem and yield did not differ significantly from similar studied indicators of soybean varieties of the northern ecotype cultivated in the soil and climatic conditions of Bryansk. It was recorded that the onset of the generative phase takes place at a lower sum of active air temperatures (763 оC), unlike in Bryansk (2150-2300 оC) during the growing season. However, at the same time, there is a loss of the phase of the period of waxy and full ripeness of the beans.
  2. Скрининг гибридных генотипов риса на наличие гена устойчивость к засолению Saltol
    Костылев П. И. Черткова Н. Г. Усатов А. В.
    Резюме Abstract | Скачать
    575.162
    Рис – это одна из важных злаковых культур, которая является источником питательных веществ более чем для половины населения земного шара. Под воздействием абиотических факторов, таких как засоление, происходит сокращение пригодных для возделывания с.-х. культур земель. Избыточное засоление не благоприятно влияет на растения риса, приводя к нарушению физико-биохимических процессов, ионного баланса, клеточных компонентов (ДНК, белков, липидов). Солеустойчивость у растений риса контролируется огромным количеством взаимосвязанных процессов и генов. QTL толерантности к солевому стрессу картированы на разных хромосомах. Основной QTL, названный как Saltol, картирован на хромосоме 1. Известны также и другие локусы, отвечающие за толерантность к солевому стрессу у растений риса, такие как SKC1 и qST1 (хромосома 1), qST3 (хромосома 3) и другие. В настоящее время известны солеустойчивые сорта риса, такие как Pokkali, Nova Bokra, Moroberikan, Bhura Ratha, R21, R26, R20, R17, IR74099 и другие. Селекция с помощью маркеров, для идентификации QTL солеустойчивости – это уникальная возможность для повышения продуктивности и устойчивости растений риса к абиотическим стрессам. Цель исследования ˗ провести скрининг и выявить толерантные к солевому стрессу гибридные генотипы риса. В качестве доноров солеустойчивости в скрещивания были внедрены известные азиатские сорта IR74099-3R-3-3, R17, R21, R26 и R20. В качестве реципиентных форм выступали сорта местной селекции Контакт, Новатор, Боярин и Аметист. Отобрали 65 гибридных линий и провели скрининг на наличие QTL солеустойчивости гена Saltol (маркер RM 493). Идентифицировано 21 гибридных генотипов с длинной ампликона 211 пн, как у донорного сорта IR74099-3R-3-3. В остальных генотипах амплификация обнаружена не была. Проведенный скрининг выявил генотипы риса с геном Saltol, которые рекомендуются для включения в программы селекции.
    10.18522/2308-9709-2024-48-5
    Rice is one of the important cereal crops, which is a source of nutrients for more than half of the world's population. Under the influence of abiotic factors, such as salinization, there is a reduction in land suitable for cultivation of agricultural crops. Excessive salinization adversely affects rice plants, leading to disruption of physical and biochemical processes, ionic balance, cellular components (DNA, proteins, lipids). Salt tolerance in rice plants is controlled by a huge number of interrelated processes and genes. QTL for salt stress tolerance are mapped on different chromosomes. The main QTL, called Saltol, is mapped on chromosome 1. Other loci responsible for salt stress tolerance in rice plants are also known, such as SKC1 and qST1 (chromosome 1), qST3 (chromosome 3), and others. Currently, salt-tolerant rice varieties such as Pokkali, Nova Bokra, Moroberikan, Bhura Ratha, R21, R26, R20, R17, IR74099 and others are known. Marker-assisted selection for identification of salt tolerance QTL is a unique opportunity to improve productivity and resistance of rice plants to abiotic stress. The purpose of the study is to screen and identify salt stress-tolerant hybrid rice genotypes. Well-known Asian varieties IR74099-3R-3-3, R17, R21, R26 and R20 were introduced into the crossing as salt tolerance donors. Locally bred varieties Contact, Novator, Boyarin and Ametist served as recipient forms. 65 hybrid lines were selected and screened for the presence of salt tolerance QTL of the Saltol gene (marker RM 493). 21 hybrid genotypes with an amplicon length of 211 bp, as in the donor variety IR74099-3R-3-3, were identified. No amplification was detected in the remaining genotypes. The screening revealed rice genotypes with the Saltol gene that are recommended for inclusion in breeding programs.
  3. Генетическая эпидемиология полногеномных ассоциативных исследований с тяжестью течения COVID-19 (обзор GWAS исследований)
    Шкетик А. А. Ид М. . Гутникова Л. В. Шкурат Т. П.
    Резюме Abstract | Скачать
    575.22/ 616-056.7
    Прошло уже более четырех лет с начала эпидемии COVID-19. Клинические и генетические данные о пациентах продолжают накапливаться, но при этом мы только в самом начале нашего понимания генетических механизмов, лежащих в основе инфекции. Цель исследования: Анализ генетических исследований на основе полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) проведенных в различных популяциях мира, для выявления ассоциаций наиболее часто встречающихся полиморфных вариантов генов у пациентов с тяжелым течением COVID-19. GWAS исследования проведенные в различных странах мира, выявили более 4 тысяч полиморфных вариантов различных генов ассоциированных с тяжелым течением COVID-19. Нами отмечено низкое совпадением полиморфных маркеров в опубликованных 274 исследованиях ассоциаций (GWAS). Так чаще всех в GWAS исследованиях регистрировали полиморфные маркеры в гене ZTFL1, они были отмечены в 53 исследованиях из 274, что составило 19,3%, совпадения полиморфных вариантов гена SLC6A20 отмечены в 10,4%, а для протекторного полиморфного локуса O (1) гена АВО совпадение составило 9% от числа всех GWAS исследований. В патогенез тяжести течения COVID-19 вовлечены не только полиморфные варианты белок кодирующих генов, но и полиморфные варианты функциональных элементов некодирующего и митохондриального генома.
    10.18522/2308-9709-2024-48-4
    More than four years have passed since the onset of the COVID-19 epidemic. Clinical and genetic data on patients continue to accumulate, but we are only at the very beginning of our understanding of the genetic mechanisms underlying the infection. Objective: To analyse genetic studies based on genome-wide association studies (GWAS) conducted in various populations around the world to identify associations of the most common polymorphic variants of genes in patients with severe COVID-19. GWAS studies conducted in various countries around the world have identified more than 4 thousand polymorphic variants in various genes associated with severe COVID-19. We noted a low concordance of polymorphic markers in 274 published association studies (GWAS). Polymorphic markers in the ZTFL1 gene were most often registered in GWAS studies; they were noted in 53 out of 274 studies, which constituted 19.3%, while concordance of polymorphic variants of the SLC6A20 gene were noted in 10.4%, and for the protective polymorphic locus O (1) of the ABO gene, the concordance was 9% of all GWAS studies. Not only polymorphic variants of protein-coding genes, but also polymorphic variants of functional elements of the non-coding and mitochondrial genome are involved in the pathogenesis of COVID-19 severity.
  4. Association of MIR125A and H19 genetic variants with the severity of COVID-19
    Ид М. . Шкурат Т. П.
    Резюме Abstract | Скачать
    616.98:578.834:575.113
    Коронавирусная инфекция 2019 (COVID-19) — инфекционное заболевание, вызываемое коронавирусом тяжелого острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2). Было выявлено несколько факторов риска восприимчивости и тяжести COVID-19, включая возраст, пол, сопутствующие заболевания и генетическую предрасположенность хозяина. Целью текущего исследования было изучение ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) генов микроРНК 125a и длинной некодирующей РНК H19 с тяжестью течения COVID-19. Пациенты были разделены на две группы с легкими и тяжелыми симптомами COVID-19. Генотипирование проводилось с использованием аллель-специфической полимеразной цепной реакции (ПЦР) в реальном времени, а также был проведен анализ многофакторного снижения размерности (MDR) для оценки моделей межгенных взаимодействия между изучаемыми полиморфизмами. Результаты показали значительную ассоциацию H19 rs217727 с тяжестью течения COVID-19 (p = 0,003). Носители MIR125A TC * H19 CC с большей вероятностью имели легкие симптомы, тогда как носители MIR125A TC * H19 CT имели более высокий риск тяжелого течения COVID-19. Результаты текущего исследования могут способствовать лучшему пониманию патогенеза COVID-19.
    10.18522/2308-9709-2024-48-3
    Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is an infectious disease, caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Several risk factors of COVID-19 susceptibility and severity have been identified, including age, gender, comorbidities, and genetic predisposition of the host. The aim of the current study was to investigate the association of single nucleotide polymorphisms (SNPs) of microRNA125a and long non-coding RNA H19 genes with the severity of COVID-19. Study subjects were divided into two groups with mild and severe COVID-19 symptoms. Genotyping was performed using allele-specific real time polymerase chain reaction (RT-PCR), and multifactor dimensionality reduction (MDR) analysis was performed to evaluate the gene-gene interaction models of the studied SNPs. The results showed a significant association of H19 rs217727 with the severity of COVID-19 (p=0.003). Carriers of MIR125A TC * H19 CC were more likely to have mild symptoms, while MIR125A TC * H19 CT carriers had a higher risk of severe COVID-19. The results of the current study may contribute to a better understanding of COVID-19 pathogenesis.
  5. New information on the Asian walnut moth Garella musculana (Erschov, 1874) (Insecta: Lepidoptera) spreading in the Rostov Region (South of European Russia)
    Романчук Р. В.
    Резюме Abstract | Скачать
    595.78
    В 2018 году на территории Ростовской области был отмечен серьезный вредитель грецкого ореха – челночница ореховая Garella musculana (Erschov, 1874). После нескольких лет затишья активность вредителя заметно возросла. С 2022 года взрослые особи стали активно и почти регулярно лететь на светоловушки. На участках мониторинга стали отмечаться не только неспецифичные повреждения, но и поврежденные ветви и плоды с гусеницами вредителя внутри. В 2023 году активность челночницы ореховой в Ростовской области снизилась, вероятно, из-за локальных погодных флуктуаций. Между тем, в последние годы вредитель отмечается на Донбассе и в Краснодарском крае. В настоящий момент можно наблюдать закрепление ореховой челночницы на новой территории и расширение ее ареала на Юге Европейской части России.
    10.18522/2308-9709-2024-48-2
    In 2018, a serious walnut pest, Garella musculana (Erschov, 1874), was noted in the Rostov Region. After several years of no records, the pest's activity has increased noticeably. Since 2022, adult individuals began to fly actively and almost regularly in light traps; not only non-specific damage, but also damaged branches and fruits with pest caterpillars inside began to be registered at monitoring sites. In 2023, the activity of the Asian walnut moth in the Rostov Region decreased, probably due to local weather fluctuations. Meanwhile, in recent years, the pest has been observed in the Donbass and Krasnodar Krai. Now, one can observe the establishment of the Asian walnut moth in a new territory and the expansion of its range in the south of the European part of Russia.
  6. Association of common OGG1 and SOD2 polymorphisms with Preeclampsia in Russian pregnant women from Rostov region
    Алаяса Н. Н. Шкурат Т. П.
    Резюме Abstract | Скачать
    575
    Введение: Преэклампсия (ПЭ) - специфическое для беременности заболевание, характеризующееся высоким артериальным давлением и протеинурией, обычно возникающее после 20 недель беременности и являющееся наиболее распространенным серьезным медицинским осложнением беременности. Цель исследования: Целью данного исследования было изучение ассоциации генетических вариантов SOD2 (rs4880) и OGG1 (rs1052133) с риском развития ПЭ у российских беременных женщин из Ростовской области. Материалы и методы: Всего в исследовании проанализировано 106 образцов (60 беременных с нормотензией и 46 беременных с преэклампсией). Генотипирование полиморфизмов (rs1052133) и (rs4880) проводили методом аллель-специфической RT-PCR. Для оценки ген-генного взаимодействия между выбранными полиморфизмами использовали анализ многофакторного снижения размерности (MDR). Результаты: Результаты исследования полиморфизма OGG1 (rs1052133) не выявили значимой ассоциации с риском ПЭ как в генотипах, так и в аллельных моделях (p>0,05). В то время как полиморфизм SOD2 (rs4880) был достоверно ассоциирован с риском ПЭ (p<0,001). Генотип SOD2 (rs4880) CC ассоциирован с повышенным риском ПЭ (OR=11,36 95 % CI [3,08-41,89]). Доминантная и рецессивная модели также связаны с повышенным риском ПЭ (OR=7,20 95 % CI [2,98-17,40]; OR=12,21 95 % CI [3,32-44,97], соответственно). В то время как генотип TT обладает протективным эффектом против развития ПЭ (OR=0,14 95 % CI [0,06-0,34]). Кроме того, частота минорного аллеля (С) была значительно выше у женщин с преэклампсией и может рассматриваться как фактор риска (p<0,001; OR=5,99 95 % CI [3,24-11,09]). По результатам MDR анализа взаимодействие генов было статистически значимым (p<0,0001). Выводы: Полученные нами результаты свидетельствуют о значимой ассоциации между генотипами полиморфизма SOD2 rs564398 и предрасположенностью к риску развития ПЭ у российских беременных женщин из Ростовской области. Следует отметить, что данное исследование является первым, в котором изучена ассоциация полиморфизма гена OGG1 (rs1052133) с предрасположенностью к ПЭ.
    10.18522/2308-9709-2024-48-1
    Background: Preeclampsia (PE) is a pregnancy-specific disorder characterized by high maternal blood pressure and protein in urine, typically occurring after 20 weeks of gestation, making it the most common serious pregnancy medical complication. The aim of this study: This study aimed to investigate the association of SOD2 (rs4880) and OGG1 (rs1052133) genetic variants with the risk of developing PE in Russian pregnant women from Rostov region. Materials and methods: A total of 106 samples (60 normotensive pregnant women and 46 preeclamptic pregnant women) were analyzed in this study. Genotyping for (rs1052133) and (rs4880) polymorphisms was done via allele specific RT-PCR. The analysis of Multifactor dimensionality reduction (MDR) was used to assess the gene-gene interaction among selected polymorphisms. Results: The results of OGG1 (rs1052133) polymorphism did not show any significant association with PE risk in both genotypes and allele models (p>0,05). While, the SOD2 (rs4880) polymorphism was significantly associated with PE risk (p<0,001). The SOD2 (rs4880) CC genotype is associated with increased risk of PE (OR=11,36 95 % CI [3,08-41,89]). Both the dominant and recessive models are also associated with increased risk of PE (OR=7,20 95 % CI [2,98-17,40]; OR=12,21 95 % CI [3,32-44,97], respectively). While the TT genotype has a protective effect against PE development (OR=0,14 95 % CI [0,06-0,34]). Moreover, the frequency of minor (C) allele was significantly higher in preeclamptic women and could be considered as a risk factor (p<0,001; OR=5,99 95 % CI [3,24-11,09]). According to the MDR results, the gene-gene interaction was statistically significant (p< 0,0001). Conclusion: Our results provided evidences of a significant association between genotypes of SOD2 rs564398 polymorphism and susceptibility to develop PE risk in Russian pregnant women from Rostov region. It is worth noting that this study is the first to examine the association of the OGG1 gene polymorphism and susceptibility to PE.

© 2012 - 2024г., Журнал «Живые и биокосные системы»

Архив Редакционная коллегия Рубрики Устав журнала Свидетельство о регистрации СМИ Лицензионный договор (Публичная оферта) с авторами журнала
16+
Сайт может содержать контент, не предназначенный для лиц младше 16 лет.
ЮФУ
Учредитель и издатель журнала:
Южный федеральный университет,
344006, Российская Федерация, г. Ростов-на-Дону, ул. Большая Садовая, 105/42.

Решение о регистрации выдано: Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций. ЭЛ № ФС 77 - 68501, от 27 января 2017.
Яндекс.Метрика