Генетика семейства WNT играет ключевую роль в развитии организма, клеточной дифференцировке и сигнальной передаче. Настоящая работа посвящена сравнению последовательностей и структур двух ключевых представителей этого семейства — генов WNT1 и WNT3A, изученных на моделях мышей (Mus musculus) и человека (Homo sapiens). Мы провели сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей указанных генов, используя методы биоинформатики, включая выравнивание последовательностей и филогенетический анализ. Сравнительный биоинформатический анализ генов WNT1/Wnt1 и WNT3A/Wnt3a у человека и мыши продемонстрировал высокую степень консервативности функционально значимых элементов, особенно в экзонах и промоторных регионах, несмотря на общую дивергенцию некодирующих последовательностей. Для гена WNT1/Wnt1 выявлена равномерная высокая идентичность (77.42%) и GC-богатые мотивы, подчёркивающие его роль в нейрогенезе, в то время как ген WNT3A/Wnt3a характеризуется островковой консервативностью (51.27%) и обогащением GC в мотивах, что отражает пластичность регуляции. Полученные результаты демонстрируют высокую степень гомологии и функциональной консервативности исследуемых генов у обоих видов, подчёркивая важность дальнейших исследований их роли в биологии развития и патологических процессах.