Тимофеева Софья Владимировна

Публикации автора:

1. Ассоциация rs920778 HOTAIR с риском развития рака молочной железы: мета-анализ
   Шалашная Е. В. Андрейко Е. А. Бакулина С. М. Бабиева С. М. Кечеджиева Э. Э. Ващенко Л. Н. Тимофеева С. В. Филиппова С. Ю. Ситковская А. О. Новикова И. А.
   Резюме Abstract | Скачать
   Мета анализ был направлен на оценку связи между полиморфизмом rs920778 HOTAIR и риском развития рака молочной железы на основе анализа данных четырех исследований случай-контроль. Поиск опубликованных исследований случай-контроль проводили в базах данных PubMed и Google Scholar. Ассоциация оценивалась по статистическим критериям отношению шансов (ОШ) с 95% доверительным интервалом (ДИ). Для проведения мета-анализа использовали программное обеспечение RevMan (Cochrane Collaboration, 5.3. Копенгаген). Для оценки связи полиморфизма rs920778 и риском развития рака молочной железы в мета анализ были включены 4 публикации (четыре исследования) с выборкой из 1347 пациентов с раком молочной железы и 1366 условно-здоровых лиц в контрольной группе. В результате исследования мы не обнаружили связь между rs920778 и риском развития рака молочной железы. Результаты, полученные при анализе данных во всех генетических моделях: гомозиготная (ОШ = 1,78, 95% ДИ: 0,72 – 4,36, Pz = 0,21, Pi2 = 0,0001), гетерозиготная (ОШ = 1,15, 95% ДИ: 0,68 – 1,96, Pz = 0,60, Pi2 = 0,00001), доминантная (ОШ = 1,00, 95% ДИ: 0,65 – 1,53, Pz = 0,99, Pi2 = 0,0001), рецессивная (ОШ = 1,62, 95% ДИ: 0,74 – 3,52, Pz = 0,23, Pi2 = 0,0002), аллельная (ОШ = 1,24, 95% ДИ: 0,80 – 1,92, Pz = 0,33, Pi2 = 0,00001). Настоящий мета анализ показал, что полиморфизм rs920778 HOTAIR не связан с риском развития рака молочной железы среди населения Азии. Для подтверждения потребуются дополнительные исследования.
2. Ассоциация полиморфизма rs1801282 гена PPARG с риском развития атеросклероза: Мета - анализ
   Тимофеева С. В. Шкурат Т. П.
   Резюме Abstract | Скачать
   Метаанализ был направлен на оценку связи между полиморфизмом rs1801282 гена PPARG и риском развития атеросклероза на основе анализа данных 20 исследований случай-контроль. Поиск опубликованных исследований случай-контроль проводили в базах данных PubMed, Web of Science и Google Scholar в период с 2000 года до февраля 2022 года. Ассоциация оценивалась по статистическим критериям отношению шансов (ОШ) с 95% доверительным интервалом (ДИ). Для проведения мета-анализа использовали программное обеспечение RevMan (Cochrane Collaboration, 5.3. Копенгаген). Для оценки связи полиморфизма PPARG Pro12Ala и риска развития атеросклероза в мета-анализ были включены 20 публикаций (двадцать исследований) с обширной выборкой 8691 случай и 11817 контролей. В целом результаты показали, что аллель Ala была связана с повышенным риском атеросклероза в азиатской популяции p=0,01, ОШ = 2.06, 95% ДИ 1.16 - 3.65; p=0,02, ОШ = 2.02, 95% ДИ 1.14 - 3.59  по сравнению с европейской популяцией. Объединенные коэффициенты риска атеросклероза на основе доминантных, рецессивных, аллельных, гомозигогтных и гетерозиготных моделей полиморфизма rs1801282 PPARG составили (p=0,96, ОШ = 1.00, 95% ДИ 0.87 - 1.15; p=0,13, ОШ = 1.21, 95% ДИ 0.95 - 1.53; p=0,88, ОШ = 1.02, 95% ДИ 0.82 - 1.26; p=0,06, ОШ = 1.26, 95% ДИ 0.99 - 1.61; p=0,53, ОШ = 0.96, 95% ДИ 0.83 - 1.10), соответственно. Настоящий мета-анализ показал, что полиморфизм rs1801282 C/G PPARG может быть связан с риском развития атеросклероза среди населения Азии. Для подтверждения наблюдаемой связи потребуются дополнительные исследования.
3. Распространенность микро РНК в интронах и окрестностях генов CGA, FSHB, LHB, TSHB у млекопитающих с формированием различного числа доминирующих фолликулов
   Тимофеева С. В. Панич А. Е. Лянгасова О. В. Шкурат Т. П. Романов Д. Е.
   Резюме Abstract | Скачать
4. Коллекция образцов опухолевых, условно-здоровых тканей и образцов крови больных раком желудка в биобанке ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России – ресурс для потенциальных молекулярно-генетических исследований
   Тимофеева С. В. Гненная Н. В. Филиппова С. Ю. Ситковская А. О. Межевова И. В. Чембарова Т. В. Новикова И. А. Колесников Е. Н. Геворкян Ю. А. Лаптева Т. О.
   Резюме Abstract | Скачать
   Рак желудка (РЖ) во всем мире является одним из самых распространенных видов этого заболевания. Из-за его запоздалой диагностики, а также высокой гетерогенности данного заболевания, прогноз для пациентов на сегодняшний день остается неудовлетворительным. Поэтому очень важно проводить молекулярно-генетические исследования, направленные на поиск новых биомаркеров – предикторов заболевания, которые позволят не только изменить подход к скринингу РЖ, но также предсказывать чувствительность пациентов и прогноз при раке желудка.С целью проведения потенциальных молекулярно-генетических исследований, на базе биобанка ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России была сформирована коллекция образцов опухолевых и условно-здоровых тканей, а также образцов крови, полученных от больных РЖ, получавших лечение в центре. В период с января 2021 по сентябрь 2022 год был произведен забор 692 образцов опухолевых и условно-здоровых тканей, а также 318 образцов крови от 173 пациентов. Средний возраст пациентов на момент забора материала составил 62,3±0,79 года. Образцы помещены в криохранилище биобанка для долгосрочного хранения при температуре -196°С. Информация о пациентах, а также вся клиническая информация хранится в деперсонализированном виде.Имеющаяся коллекция образцов опухолевого материала, а также образцов крови пациентов с РЖ, в сочетании с клинической информацией, ассоциированной с имеющимися образцами, является ценным ресурсом для фундаментальных исследований.
5. Опыт получения многокомпонентной трёхмерной клеточной модели опухолевого роста для молекулярно-генетических исследований рака молочной железы
   Шульгина О. Г. Тимофеева С. В. Гненная Н. В. Филиппова С. Ю. Ситковская А. О. Межевова И. В. Чембарова Т. В. Новикова И. А.
   Резюме Abstract | Скачать
   АннотацияРак молочной железы остаётся актуальной проблемой современного здравоохранения во всём мире. Разработка новых эффективных противоопухолевых средств опирается на in vitro модели, максимально приближенные к опухоли in situ по своим молекулярно-генетическим свойствам. По общему представлению, в перспективной клеточной модели должны воспроизводиться ключевые элементы микроокружения опухоли, а также наблюдаемые в опухоли градиенты газов и питательных веществ. Данным требованиям отвечают многокомпонентные трёхмерные клеточные модели опухолевого роста, получившие широкое распространение в экспериментальной онкологии. Несмотря на значительное количество существующих примеров реализации таких моделей, проблема поиска экономически выгодных технологических решений, способных предоставить материал для как можно более широкого спектра исследований – от молекулярных до гистологических, остаётся актуальной. В данной работе нами протестирован адаптированный метод висячей капли для получения многокомпонентной трёхмерной модели опухолевого роста рака молочной железы, представляющей собой сфероид из клеток рака молочной железы BT20, заключенный в коллагеновый сгусток с фибробластами. Новизна работы заключается в последовательном введении компонентов модели непосредственно в каплю в отличие от более распространённых подходов, предполагающих перенос клеточных агломератов и их заключение в биогели. Предлагаемое нами техническое решение основывается на применении покрытия из СИЭЛ 159-330, способствующего ускоренному формированию агломератов в висячей капле – свойства, необходимого для облегчения замены среды. Полученные в ходе работы конструкты обладали гистологическим сходством с опухолью in situ однако нам не удалось добиться контактного взаимодействия между клетками опухоли и микроокружением.