Сахарная свекла – важная техническая культура, на долю которой приходится около 40% мирового производства сахара. Получение современных гибридов сахарной свёклы, состоящих как минимум из трёх компонентов, основано на сложной схеме скрещиваний: выровненная мужски стерильная (МС) линия, поддерживаемая линией О-типа, скрещивается с линией-опылителем. При производстве коммерческих семян гибрида необходимо контролировать все линии-компоненты, использующиеся для получения как промежуточных, так и финального гибрида. В данном исследовании показано применение технологии генетической идентификации растений сахарной свёклы в процессе создания и первичного семеноводства линий-компонентов гибридов селекции ФГБНУ «Первомайская селекционно-опытная станция сахарной свеклы». Предлагаемый подход включает мультиплексную ПЦР по 10 микросателлитным локусам (FDSB1001, FDSB1033, SB04, SB09, SB15, Unigene16898, Unigene17623B, Unigene17923, Unigene26753, Unigene27833) с последующим электрофоретическим анализом полученных фрагментов ДНК в одном капилляре генетического анализатора. На первом этапе настоящей работы были проанализированы исходные растения первого года жизни (корнеплоды-штеклинги) линий-компонентов гибридов сахарной свеклы. Результаты анализа цифровых ДНК-профилей исследуемых линий показали, что большинство родительских линий были однородны и имели уникальные генотипы. На следующий год с этих маточных растений были получены семена, после высева растений (потомства) также были получены ДНК-профили. Все проанализированные генотипы внутри каждой из 8 линий оказались однородными и совпали по генотипу с исходными маточными растениями, в то время как у 3-х линий генотипы оказались неоднородными и содержали примеси чужеродных генотипов. Неоднородные генотипы были исключены из дальнейшего процесса семеноводства, работа была продолжена с гомогенными генотипами, которые послужили источником оригинальных семян для дальнейшего семеноводства сахарной свеклы данных линий. Таким образом, применение молекулярно-генетического анализа позволяет отслеживать качество размножаемых линий-компонентов гибридов сахарной свеклы.