Иванова Екатерина Сергеевна

Публикации автора:

1. Анализ межгенных взаимодействий полиморфных локусов генов TYK2, miR-146a и miR-155 у пациентов с разной степенью течения коронавирусной инфекции COVID-19
   Долгушин И. С. Затонский С. А. Иванова Е. С. Александрова А. А. Шкурат Т. П.
   Резюме Abstract | Скачать
   Введение: Накопленные данные свидетельствуют о том, что наряду с возрастом, полом и сопутствующими заболеваниями существенное влияние на тяжесть COVID-19 оказывают генетические особенности организма хозяина, однако механизмы, определяющие индивидуальную вариабельность клинических проявлений инфекции, остаются предметом активного изучения. Цель: оценить ассоциации генетических вариантов TYK2 rs11085727, miR-146a rs2910164 и miR-155 rs767649 с тяжестью течения COVID-19, а также изучить возможные межгенные взаимодействия между указанными локусами. Материалы и методы. В исследование включены 217 пациентов, перенёсших COVID-19 (113 - с лёгким течением, 104 - с тяжёлым). Генотипирование проводили методом оценки длины рестрикционных фрагментов (TYK2) и аллель-специфической ПЦР (miR-146a, miR-155). Для изучения межгенных взаимодействий использовали алгоритм многомерного снижения размерности (Multifactor Dimensionality Reduction - MDR) версии 3.0.2 (He et al., 2009). Статистическую обработку проводили с использованием критерия χ², точного критерия Фишера, расчёта отношения шансов (OR) с 95% доверительным интервалом. Результаты: Анализ отдельных полиморфных локусов не выявил статистически значимых ассоциаций с тяжестью COVID-19, однако для гена TYK2 rs11085727 отмечена тенденция к протективному эффекту минорного аллеля T (p = 0,078). MDR-анализ выявил трёхлокусную эпистатическую модель (TYK2, miR-146a, miR-155) со сбалансированной точностью 0,675. Комбинация генотипов геновTYK2(CC), miR-146a(GG) и miR-155(TT) ассоциирована с повышенным риском тяжёлого течения COVID-19: OR = 2,24 (95% ДИ: 1,00–5,03; p = 0,044). Заключение: Эпистатические взаимодействия между генами TYK2, miR-146a и miR-155 вносят вклад в формирование тяжести течения COVID-19, что обосновывает дальнейшее изучение межгенных взаимодействий в патогенезе коронавирусной инфекции
2. Генетические варианты IL-6 (rs1800795) и CYP3A4 (rs2740574) как предикторы тяжести течения коронавирусной инфекции COVID-19
   Этингер С. М. Затонский С. А. Григорян Н. А. Иванова Е. С. Бутенко Е. В.
   Резюме Abstract | Скачать
   Введение. Течение COVID-19 варьирует от бессимптомного до критического, что определяется комплексом факторов, включая генетическую предрасположенность. Гены, кодирующие провоспалительные цитокины и ферменты метаболизма ксенобиотиков, являются кандидатами, модулирующими ответ организма на вирус SARS-CoV-2. Цель. Исследовать ассоциацию полиморфных локусов генов IL-6 (rs1800795), СYP3A4 (rs2740574), CYP2D6 (rs1065852), CYP3A4 (rs28371759), CYP2D6 (rs3892097), CYP3A5(rs776746), CYP1A2 (rs2069522) у пациентов с различной тяжестью течения коронавирусной инфекции COVID-19 Материалы и методы. В исследование включено 217 пациентов, перенесших COVID-19, разделенных на группы легкого (n=113) и тяжелого (n=104) течения коронавирусной инфекции. Проведено генотипирование методом аллель-специфичной ПЦР. Статистический анализ выполнен с использованием U-критерия Манна–Уитни, критерия χ² Пирсона и расчета отношения шансов. Результаты. Пациенты группы тяжелого течения были старше (55,1±11,1 vs. 46,0±15,1 года, p<0,001) и имели более высокий ИМТ (29,2±5,1 vs. 25,6±5,0 кг/м², p<0,001). Установлена ассоциация полиморфизма IL-6 rs1800795 с тяжестью COVID-19: аллель G чаще встречался в группе тяжелого течения (70,2% vs. 52,7%, OR=2,11, p<0,001), аллель C — в группе легкого течения (47,3% vs. 29,8%, OR=0,47, p<0,001). Для полиморфизма CYP3A4 rs2740574 генотип AA чаще встречался в группе тяжелого течения (90,4% vs. 78,8%, OR=2,53, p=0,018), тогда как носительство аллеля G было значительно выше в группе легкого течения (21,2% vs. 9,6%, OR=0,39, p=0,018). Для CYP1A2 (rs2069522), CYP3A4 (rs28371759), CYP2D6 (rs1065852, rs3892097) и CYP3A5 (rs776746) значимых различий не выявлено. Заключение. Генетические варианты IL-6 rs1800795 и CYP3A4 rs2740574 являются значимыми предикторами тяжести COVID-19 и могут быть использованы для стратификации пациентов по риску развития тяжелых форм заболевания.
3. Генетические варианты TYK2 как предикторы тяжелой формы COVID-19
   Милютина Н. П. Иванова Е. С. Шкурат Т. П.
   Резюме Abstract | Скачать
   В обзоре обобщены представления о роли вариантов гена TYK2 в развитии критического фенотипа COVID-19 - тяжелой формы заболевания. Рассмотрена роль тирозинкиназы 2 в функционировании сигнального пути JAK-STAT и дана молекулярная характеристика фермента. Показано, что миссенс-варианты гена TYK2 - rs12720356-С, rs2304255-Т, rs2304256-А, rs34536443-С, rs35018800-А, связанные с важнейшими доменами фермента - киназным, псевдокиназным и FERM, - ассоциированы с развитием тяжелой формы COVID-19. Генетические варианты TYK2, локализованные в интронных и некодирующих областях гена (rs11085727-Т, rs12720270-G, rs12720358-T, rs280500-AG, rs74956615-A) также ассоциированы с тяжелой формой коронавирусной болезни. Напротив, полиморфные локусы rs280519-AG и rs8108236-АА ассоциированы с пониженным риском развития тяжелой формы COVID-19.
4. Особенности регуляции системы цитохромов P450 при COVID-19: генетические и метаболические аспекты.
   Прокофьев В. Н. Милютина Н. П. Мельникова Е. С. Григорян Н. А. Иванова Е. С. Шкурат Т. П.
   Резюме Abstract | Скачать
   В обзоре рассмотрена общая характеристика системы цитохромов Р450, генетическая изменчивость генов CYP. Показана исключительная важность данной системы в молекулярном патогенезе COVID-19. Проанализированы исследования авторов, свидетельствующие о важной роли генетической вариабельности системы CYP в предрасположенности к риску заражения SARS-CoV-2, а также влиянии на тяжесть заболевания. Рассмотрены данные исследований об ингибирующем влиянии провоспалительных цитокинов при COVID-19 на активность ферментов Р450, что способствует развитию глубоких метаболических нарушений при коронавирусной болезни.