Бутенко Елена Викторовна

Публикации автора:

1. Генетические варианты IL-6 (rs1800795) и CYP3A4 (rs2740574) как предикторы тяжести течения коронавирусной инфекции COVID-19
   Этингер С. М. Затонский С. А. Григорян Н. А. Иванова Е. С. Бутенко Е. В.
   Резюме Abstract | Скачать
   Введение. Течение COVID-19 варьирует от бессимптомного до критического, что определяется комплексом факторов, включая генетическую предрасположенность. Гены, кодирующие провоспалительные цитокины и ферменты метаболизма ксенобиотиков, являются кандидатами, модулирующими ответ организма на вирус SARS-CoV-2. Цель. Исследовать ассоциацию полиморфных локусов генов IL-6 (rs1800795), СYP3A4 (rs2740574), CYP2D6 (rs1065852), CYP3A4 (rs28371759), CYP2D6 (rs3892097), CYP3A5(rs776746), CYP1A2 (rs2069522) у пациентов с различной тяжестью течения коронавирусной инфекции COVID-19 Материалы и методы. В исследование включено 217 пациентов, перенесших COVID-19, разделенных на группы легкого (n=113) и тяжелого (n=104) течения коронавирусной инфекции. Проведено генотипирование методом аллель-специфичной ПЦР. Статистический анализ выполнен с использованием U-критерия Манна–Уитни, критерия χ² Пирсона и расчета отношения шансов. Результаты. Пациенты группы тяжелого течения были старше (55,1±11,1 vs. 46,0±15,1 года, p<0,001) и имели более высокий ИМТ (29,2±5,1 vs. 25,6±5,0 кг/м², p<0,001). Установлена ассоциация полиморфизма IL-6 rs1800795 с тяжестью COVID-19: аллель G чаще встречался в группе тяжелого течения (70,2% vs. 52,7%, OR=2,11, p<0,001), аллель C — в группе легкого течения (47,3% vs. 29,8%, OR=0,47, p<0,001). Для полиморфизма CYP3A4 rs2740574 генотип AA чаще встречался в группе тяжелого течения (90,4% vs. 78,8%, OR=2,53, p=0,018), тогда как носительство аллеля G было значительно выше в группе легкого течения (21,2% vs. 9,6%, OR=0,39, p=0,018). Для CYP1A2 (rs2069522), CYP3A4 (rs28371759), CYP2D6 (rs1065852, rs3892097) и CYP3A5 (rs776746) значимых различий не выявлено. Заключение. Генетические варианты IL-6 rs1800795 и CYP3A4 rs2740574 являются значимыми предикторами тяжести COVID-19 и могут быть использованы для стратификации пациентов по риску развития тяжелых форм заболевания.
2. Роль однонуклеотидных полиморфизмов в сайтах связывания микроРНК, регулирующих энергетический обмен, в патогенезе ожирения
   Носова В. О. Бутенко Е. В.
   Резюме Abstract | Скачать
   Ожирение представляет собой сложное полиэтиологическое заболевание, патогенез которого тесно связан с дисбалансом между депонированием и мобилизацией энергетических субстратов. Недавние исследования выявили, что однонуклеотидные полиморфизмы (ОНП, SNP), локализованные в сайтах связывания микроРНК (miRNA, microRNA) в 3′-нетранслируемых регионах (3′-UTR) метаболически значимых генов, участвующих в энергетическом обмене, могут нарушать посттранскрипционную регуляцию, способствуя развитию инсулинорезистентности, дислипидемии и воспаления жировой ткани. Цель данного обзора – систематизация современных данных о роли однонуклеотидных полиморфизмов в сайтах связывания микроРНК в 3′-нетранслируемых регионах метаболически связанных генов в патогенезе ожирения. В этом обзоре обобщены данные публикаций, опубликованные в российских и международных рецензируемых журналах, отобранные из баз данных PubMed, РИНЦ, ScienceDirect по ключевым словам: «ожирение», «SNP», «энергетический гомеостаз», а также их английским эквивалентам: “obesity”, “SNP”, “energy homeostasis”. В анализ включены только полнотекстовые статьи, содержащие как фундаментальные, так и клинические исследования о функциональных SNP в сайтах связывания miR-27 (PPARG), miR-181d (ANGPTL3), miR-143 (ERK5), miR-155 (C/EBPβ) и других. Особое внимание уделено SNP с присвоенными rsID (например, rs1801260, rs524134), а также предсказанным или новым вариантам, ещё не вошедшим в базы данных. Проанализирована роль циркулирующих miRNA (miR-126, miR-29a, miR-34a) как неинвазивных биомаркеров и межтканевых сигнальных молекул. Подчеркнута роль полиморфизма rs1801260 в гене CLOCK, влияющего на циркадную регуляцию обмена веществ и качество сна у пациентов с ожирением. Совокупность этих данных указывает на то, что интеграция геномных, транскриптомных и эпигенетических профилей открывает новые горизонты для персонализированной диагностики и терапии ожирения.
3. Транскриптомный профиль микро РНК в кумулюсных гранулезных клетках человека
   Гутникова Л. В. Бутенко Е. В.
   Резюме Abstract | Скачать
   Транскриптомный профиль зрелых miRNA гранулезных клеток человека в кумулюсе, без учета родственных последовательностей, представлен следующими молекулами: hsa-miR-320; hsa-miR-21; hsa-miR-193; hsa-miR-1307; hsa-miR-10395; hsa-miR-127; hsa-let-7; hsa-miR-99; hsa-miR-744 hsa-miR-514; hsa-miR-629; hsa-miR 125; hsa-miR 140; hsa-miR 149; hsa-miR 181; hsa-miR-1291; hsa-miR 125; hsa-miR 151; hsa-miR 106; hsa-miR 365. Наше исследование позволяет получить ценные сведения о транскриптоме и регуляторных механизмах транскрипции в ооцитах и клетках кумулюса. В этом исследовании мы оценивали только транскрипционный профиль клеток кумулюса, непосредственно окружающих ооцит. Эти клетки кумулюса играют ключевую роль на заключительных стадиях созревания ооцита, напрямую контактируя с ооцитом и доставляя метаболические субстраты. Выявление микроРНК, специфичных для гранулезных клеток, поможет исследователям лучше понять механизмы, лежащие в основе заболеваний яичников.
4. Биоинформационный поиск генов микроРНК и днРНК вокруг генов, участвующих в патогенезе синдрома поликистоза яичников у человека
   Липович Л. . Бутенко Е. В.
   Резюме Abstract | Скачать
   Целью данного исследования было выявление локализации длинной некодирующей РНК (днРНК) и микроРНК, а также однонуклеотидных полиморфизмов в генах днРНК и микроРНК в цис-регуляторных районах генов, вовлеченных в процесс фолликулогенеза, для понимания их роли в молекулярной патофизиологии синдрома поликистозных яичников (СПКЯ). Поиск функциональных элементов проводили при помощи геномного браузера UCSC. Всего было изучено 33 гена, в последовательности и ближайшем генном окружении которых выявлено 20 днРНК, из них 17 антисмысловых, 4 гена микроРНК в интронах, сайты связывания 121 микроРНК, 16 полиморфных локусов внутри генов днРНК, ассоциированных с различными патологиями по данным GWAS исследований. Изучение роли микроРНК и днРНК в гранулезных клетках не только даст новое понимание молекулярных механизмов физиологии яичников, но также может открыть новые терапевтические мишени для лечения гинекологических заболеваний, в частности, СПКЯ.
5. Распространенность сайтов связывания miRNA и lncRNA вокруг некоторых генов, ассоциированных с ожирением
   Лянгасова О. В. Шкурат Т. П. Шкурат М. А. Деревянчук Е. Г. Липович Л. . Романов Д. Е. Амелина М. А. Бутенко Е. В. Алаа Х. А.
   Резюме Abstract | Скачать
   Изучена локализация сайтов связывания miRNA и lncRNA вокруг генов FTO, APOC1, LIPC, LPL и APOE. Показано, что наибольшее число сайтов связывания с miRNA и lncRNA находится в цис-регуляторных участках и интронах гена FTO. Представлен перечень мотивов miRNA и lncRNA. Выдвинута гипотеза, что количество сайтов связывания miRNA и lncRNA в интронах и цис-регуляторных районах генов коррелирует с числом тканей, в которых экспрессируется ген, и с числом функций его белка.