Выпуск №55 Март 2026

1. Концепция «жизнь как вычисление» в системном анализе почвенных процессов (обзор). часть 1
   Брень А. Б. Одабашян М. Ю. Горбов С. Н. Безуглова О. С. Вардуни Т. В. Чистяков В. А.
   Резюме Abstract | Скачать
   005:631.4

   Перспективный аналитический обзор, цель которого – обосновать возможность применения для изучения сложной динамики почвенных процессов нового междисциплинарного подхода, основанного на концепции «жизнь как вычисление» (life-as-computation). В первой части обзора рассматривается потенциал применения метафоры и методологического аппарата концепции «жизнь как вычисление» к фундаментальным проблемам современного почвоведения, связанным с абиотической деградацией почв, динамикой органического вещества и влиянием климатических изменений. На основе анализа актуальных источников систематизированы современные вызовы, включая эрозию, засоление, переуплотнение, дегумификацию и трансформацию водно-теплового режима почв. На основе интегративного анализа, объединяющего методы теоретической биологии, биоинформатики и теории информации, показано, что к почве применим подход, интерпретирующий ее как вычислительную сеть, где биологические и химические процессы представляют собой алгоритмические взаимодействия. Таким образом открываются возможности для разработки более точных прогностических моделей. Эти модели могут быть использованы для оптимизации сельскохозяйственных практик и управления почвенными ресурсами.

   10.18522/2308-9709-2026-55-21

   A promising analytical review, the purpose of which is to substantiate the possibility of applying a new interdisciplinary approach based on the concept of "life as computation" to study the complex dynamics of soil processes. The first part of the review examines the potential of applying the metaphor and methodological framework of the concept of "life as computation" to the fundamental problems of modern soil science related to abiotic soil degradation, organic matter dynamics and the impact of climate change. Based on the analysis of current sources, modern challenges are systematized, including erosion, salinization, over-compaction, dehumidification and transformation of the water-thermal regime of soils. Based on an integrative analysis combining the methods of theoretical biology, bioinformatics and information theory, it is shown that an approach is applicable to soil that interprets it as a computer network where biological and chemical processes represent algorithmic interactions. This opens up opportunities for developing more accurate predictive models. These models can be used to optimize agricultural practices and manage soil resources.
2. Концепция «жизнь как вычисление» в системном анализе почвенных процессов (обзор). часть 2
   Брень А. Б. Одабашян М. Ю. Горбов С. Н. Безуглова О. С. Вардуни Т. В. Чистяков В. А.
   Резюме Abstract | Скачать
   005:631.4

   Продолжение аналитического обзора, посвященного обоснованию возможности применения и ограничениям концепции «жизнь как вычисление» применительно к системному анализу ключевых почвенных процессов и решению актуальных проблем современного почвоведения. Вторая часть обзора посвящена анализу применимости концепции «жизнь как вычисление» к исследовательским задачам, лежащим на стыке почвенной биологии, антропогенной трансформации и методов обработки больших данных. Объектом анализа выступают проблемы сохранения биоразнообразия, функционирования урбанизированных почв, оптимизации землепользования и современного мониторинга (ГИС, дистанционное зондирование, ИИ). Показано, что почвенное микробное сообщество может рассматриваться как распределенная сетевая структура, реализующая принципы «биокомпьютации» через метаболические пути и горизонтальный перенос генов. Особое внимание уделено роли ризосферных взаимодействий как каналов информационного обмена в системе «почва-растение». Обсуждается, как методы искусственного интеллекта и машинного обучения, применяемые для классификации почв (включая городские) и прогнозирования их свойств, фактически являются «мета-уровнем» анализа вычислительных способностей педосферы. Показано, что концепция «жизнь как вычисление» открывает новые перспективы для системного анализа и моделирования почвенных процессов, однако её применение требует учёта эмерджентных свойств биологических систем; в целом, интеграция этой концепции в почвоведение способствует формированию новой методологической базы, отвечающей вызовам антропоцена.

   10.18522/2308-9709-2026-55-22

   Continuation of the analytical review devoted to substantiating the feasibility and limitations of the concept of "life as a computation" in relation to the systematic analysis of key soil processes and solving urgent problems of modern soil science. The second part of the review is devoted to the analysis of the applicability of the concept of "life as computation" to research tasks that lie at the intersection of soil biology, anthropogenic transformation and big data processing methods. The object of the analysis is the problems of biodiversity conservation, functioning of urbanized soils, optimization of land use and modern monitoring (GIS, remote sensing, AI). It is shown that the soil microbial community can be considered as a distributed network structure implementing the principles of "biocomputation" through metabolic pathways and horizontal gene transfer. Special attention is paid to the role of rhizospheric interactions as channels of information exchange in the soil-plant system. It discusses how artificial intelligence and machine learning methods used to classify soils (including urban ones) and predict their properties are actually a "meta-level" analysis of the computational abilities of the pedosphere. It is shown that the concept of "life as computation" opens up new perspectives for system analysis and modeling of soil processes, however, its application requires taking into account the emergent properties of biological systems; in general, the integration of this concept into soil science contributes to the formation of a new methodological framework that meets the anthropocene challenges.
3. Структурный и филогенетический анализ генов WNT1 и WNT3A у человека и мыши
   Ячнева С. В. Колесникова А. М. Григорян Н. А. Шкурат Т. П. Бутенко Е. В.
   Резюме Abstract | Скачать
   575

   Генетика семейства WNT играет ключевую роль в развитии организма, клеточной дифференцировке и сигнальной передаче. Настоящая работа посвящена сравнению последовательностей и структур двух ключевых представителей этого семейства — генов WNT1 и WNT3A, изученных на моделях мышей (Mus musculus) и человека (Homo sapiens). Мы провели сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей указанных генов, используя методы биоинформатики, включая выравнивание последовательностей и филогенетический анализ. Сравнительный биоинформатический анализ генов WNT1/Wnt1 и WNT3A/Wnt3a у человека и мыши продемонстрировал высокую степень консервативности функционально значимых элементов, особенно в экзонах и промоторных регионах, несмотря на общую дивергенцию некодирующих последовательностей. Для гена WNT1/Wnt1 выявлена равномерная высокая идентичность (77.42%) и GC-богатые мотивы, подчёркивающие его роль в нейрогенезе, в то время как ген WNT3A/Wnt3a характеризуется островковой консервативностью (51.27%) и обогащением GC в мотивах, что отражает пластичность регуляции. Полученные результаты демонстрируют высокую степень гомологии и функциональной консервативности исследуемых генов у обоих видов, подчёркивая важность дальнейших исследований их роли в биологии развития и патологических процессах.

   10.18522/2308-9709-2026-55-20

   The WNT gene family plays a key role in organismal development, cell differentiation, and signal transduction. This study compares the sequences and structures of two key members of this family — the WNT1 and WNT3A genes — studied in mouse (Mus musculus) and human (Homo sapiens) models. We performed a comparative analysis of the nucleotide sequences of these genes using bioinformatic methods, including sequence alignment and phylogenetic analysis. The comparative bioinformatic analysis of the WNT1/Wnt1 and WNT3A/Wnt3a genes in human and mouse demonstrated a high degree of conservation of functionally significant elements, especially in exons and promoter regions, despite the overall divergence of non-coding sequences. For the WNT1/Wnt1 gene, a uniformly high identity (77.42%) and GC-rich motifs were revealed, emphasizing its role in neurogenesis, whereas the WNT3A/Wnt3a gene is characterized by island-like conservation (51.27%) and GC enrichment in motifs, reflecting regulatory plasticity. The obtained results demonstrate a high degree of homology and functional conservation of the studied genes in both species, highlighting the importance of further research into their role in developmental biology and pathological processes.
4. Комбинированное загрязнение лесных почв Ямала тяжёлыми металлами (Cd, Cu, Ni, Zn, Pb, Cr, Hg) и оценка их методами биотестирования
   Коркунов Р. Ю.
   Резюме Abstract | Скачать
   504.53.054:502.175

   Актуальность и цель. Лесные почвы арктического региона испытывают комбинированное загрязнение тяжёлыми металлами. Цель работы — оценить острую токсичность лесных почв Ямала, загрязнённых тяжёлыми металлами, методами биотестирования. Материал и методы. Отобрано 11 проб почв в Надымском районе ЯНАО. Определяли валовое содержание Cd, Cu, Ni, Zn, Pb, Cr, Hg, а также pH, нефтепродукты, фенолы, АПАВ. На водных вытяжках (1:10) проведено биотестирование на Chlorella vulgaris (индекс токсичности I, 22 ч) и Daphnia magna (гибель, 48 ч) с рядом разведений. Результаты. Почвы кислые (pH 4.5–4.6). Установлено, что пробы 1–5, 8 и 9 вызывают гибель дафний 13–23 % в неразбавленной вытяжке (острая токсичность), тогда как хлорелла не превышала порога I≥20%. Наибольшая токсичность у пробы 9 (Cd 0.245 мг/кг, Ni 4.5 мг/кг). Кратность разведения для устранения токсичности Kр = 1 (V класс опасности). Корреляция токсичности с содержанием Cd (r=0.72), Ni (r=0.68) и фенолов (r=0.51) значима (p<0.05). Заключение. Комбинация химического анализа и биотестирования на Daphnia magna эффективна для мониторинга лесных почв в зонах комбинированного загрязнения.

   10.18522/2308-9709-2026-55-19

   Background and aim. Forest soils of the Arctic region are subject to combined heavy metal pollution. The aim of this study was to assess the acute toxicity of Yamal Forest soils contaminated with heavy metals using biotesting methods. Material and methods. Eleven soil samples were taken in the Nadym district of the Yamal-Nenets Autonomous Okrug. Total concentrations of Cd, Cu, Ni, Zn, Pb, Cr, Hg, as well as pH, petroleum products, phenols, and anionic surfactants were determined. Biotesting was performed on water extracts (1:10) using Chlorella vulgaris (toxicity index I, 22 h) and Daphnia magna (mortality, 48 h) with a series of dilutions. Results. The soils were acidic (pH 4.5–4.6). Samples 1–5, 8 and 9 caused 13–23 % mortality of D. magna in undiluted extract (acute toxicity), while C. vulgaris did not exceed the threshold I ≥ 20 %. The highest toxicity was found in sample 9 (Cd 0.245 mg/kg, Ni 4.5 mg/kg). The dilution ratio eliminating toxicity was Kr = 1 (hazard class V). Correlations of toxicity with Cd (r = 0.72), Ni (r = 0.68) and phenols (r = 0.51) were significant (p < 0.05). Conclusion. The combination of chemical analysis and biotesting with Daphnia magna is effective for monitoring forest soils in areas of combined pollution.
5. Экотоксикологические показатели воды рек Дон и Темерник в акватории городов Ростов-на-Дону и Азов
   Седова Д. А. Климова М. В. Сазыкин И. С. Сазыкина М. А.
   Резюме Abstract | Скачать
   (504.4.054 : 574.64: 579.63)

   Биолюминесцентные методы с применением батареи цельноклеточных бактериальных lux-биосенсоров могут оперативно дать предварительную оценку токсичности водных экосистем при антропогенном загрязнении. Цель настоящей работы – оценка экотоксикологических эффектов проб воды рек Дон и Темерник в акватории городов Ростов-на-Дону и Азов. Исследование проводили в 2021-2023 г., было проанализировано 58 проб воды рек Дон и Темерник (27 – в акватории г. Азова, 31 – в акватории г. Ростова-на-Дону). Пробы воды отбирали в местах водозаборов, рекреации, селитебных территорий, сброса сточных вод. Для исследования интегральной токсичности проб воды использовали природный биолюминесцентный штамм Vibrio aquamarinus ВКПМ B-11245. Генотоксичность, прооксидантные свойства, наличие веществ, повреждающих белки и нарушающих целостность клеточных мембран, индукторов кворум-сенсинга в поверхностных водах определяли с помощью рекомбинантных штаммов E. coli MG1655. Результаты указывают на существенную нагрузку на р. Дон в обеих акваториях веществами, вызывающими повреждения мембран и ДНК, индукторами кворум-сенсинга I типа. Высокотоксичных проб выявлено не было. Сравнение интегральной токсичности проб из двух акваторий показало статистически значимое превышение токсичности в г. Азов по сравнению с г. Ростов-на-Дону. Достоверные различия между токсичностью проб воды выявлены с помощью трех lux-биосенсоров: E. coli MG1655 (pRecA-lux), E. coli MG1655 (pFabA-lux) и E. coli MG1655 (pVFR1-lux). Во всех случаях токсичность и наличие индукторов кворум сенсинга I типа значимо выше в пробах воды из г. Азова.

   10.18522/2308-9709-2026-55-18

   Bioluminescent methods using a battery of whole-cell bacterial lux biosensors can quickly provide preliminary assessments of the toxicity of aquatic ecosystems exposed to anthropogenic pollution. The aim of this study was to evaluate the ecotoxicological effects of water samples from the Don and Temernik rivers in the waters of Rostov-on-Don and Azov. The study was conducted from 2021 to 2023, analyzing 58 water samples from the Don and Temernik rivers (27 in the waters of Azov and 31 in the waters of Rostov-on-Don). Water samples were collected at water intake sites, recreational areas, residential areas, and wastewater discharge points. The natural bioluminescent strain Vibrio aquamarinus VKPM B-11245 was used to study the integral toxicity of the water samples. Genotoxicity, prooxidant properties, the presence of substances damaging proteins and violating the integrity of cell membranes, and quorum sensing inducers in surface waters were determined using recombinant E. coli MG1655 strains. The results indicate a significant load on the Don River in both water areas with substances causing membrane and DNA damage, and type I quorum sensing inducers. No highly toxic samples were detected. Comparison of the integrated toxicity of samples from the two water areas showed a statistically significant excess of toxicity in the city of Azov compared to Rostov-on-Don. Reliable differences between the toxicity of water samples were detected using three lux biosensors: E. coli MG1655 (pRecA-lux), E. coli MG1655 (pFabA-lux), and E. coli MG1655 (pVFR1-lux). In all cases, toxicity and the presence of quorum sensing inducers type I were significantly higher in water samples from the city of Azov.
6. Анализ межгенных взаимодействий полиморфных локусов генов TYK2, miR-146a и miR-155 у пациентов с разной степенью течения коронавирусной инфекции COVID-19
   Долгушин И. С. Затонский С. А. Иванова Е. С. Александрова А. А. Шкурат Т. П.
   Резюме Abstract | Скачать
   575

   Введение: Накопленные данные свидетельствуют о том, что наряду с возрастом, полом и сопутствующими заболеваниями существенное влияние на тяжесть COVID-19 оказывают генетические особенности организма хозяина, однако механизмы, определяющие индивидуальную вариабельность клинических проявлений инфекции, остаются предметом активного изучения. Цель: оценить ассоциации генетических вариантов TYK2 rs11085727, miR-146a rs2910164 и miR-155 rs767649 с тяжестью течения COVID-19, а также изучить возможные межгенные взаимодействия между указанными локусами. Материалы и методы. В исследование включены 217 пациентов, перенёсших COVID-19 (113 - с лёгким течением, 104 - с тяжёлым). Генотипирование проводили методом оценки длины рестрикционных фрагментов (TYK2) и аллель-специфической ПЦР (miR-146a, miR-155). Для изучения межгенных взаимодействий использовали алгоритм многомерного снижения размерности (Multifactor Dimensionality Reduction - MDR) версии 3.0.2 (He et al., 2009). Статистическую обработку проводили с использованием критерия χ², точного критерия Фишера, расчёта отношения шансов (OR) с 95% доверительным интервалом. Результаты: Анализ отдельных полиморфных локусов не выявил статистически значимых ассоциаций с тяжестью COVID-19, однако для гена TYK2 rs11085727 отмечена тенденция к протективному эффекту минорного аллеля T (p = 0,078). MDR-анализ выявил трёхлокусную эпистатическую модель (TYK2, miR-146a, miR-155) со сбалансированной точностью 0,675. Комбинация генотипов геновTYK2(CC), miR-146a(GG) и miR-155(TT) ассоциирована с повышенным риском тяжёлого течения COVID-19: OR = 2,24 (95% ДИ: 1,00–5,03; p = 0,044). Заключение: Эпистатические взаимодействия между генами TYK2, miR-146a и miR-155 вносят вклад в формирование тяжести течения COVID-19, что обосновывает дальнейшее изучение межгенных взаимодействий в патогенезе коронавирусной инфекции

   10.18522/2308-9709-2026-55-17

   Introduction. Accumulating evidence indicates that along with age, sex, and comorbidities, host genetic factors significantly influence the severity of COVID-19. However, the mechanisms underlying the individual variability in clinical manifestations of the infection remain an active area of investigation. Objective. To assess the associations of the TYK2 rs11085727, miR-146a rs2910164, and miR-155 rs767649 genetic variants with the severity of COVID-19, and to investigate possible gene-gene interactions between these loci. Materials and methods. The study included 217 patients who had recovered from COVID-19 (113 with mild course, 104 with severe course). Genotyping was performed using restriction fragment length polymorphism analysis (TYK2) and allele-specific PCR (miR-146a, miR-155). Analysis of gene-gene interactions was performed using the Multifactor Dimensionality Reduction (MDR) method. Statistical analysis included the χ² test, Fisher's exact test, and calculation of odds ratios (OR) with 95% confidence intervals. Results. Analysis of individual polymorphic loci revealed no statistically significant associations with COVID-19 severity. However, a trend toward a protective effect of the minor T allele of the TYK2 rs11085727 polymorphism was observed (p = 0.078). MDR analysis identified a three-locus epistatic model (TYK2, miR-146a, miR-155) with a balanced accuracy of 0.675. The genotype combination TYK2 (CC), miR-146a (GG), miR-155(TT) was associated with an increased risk of severe COVID-19: OR = 2.24 (95% CI: 1.00–5.03; p = 0.044). Conclusion. Epistatic interactions between TYK2, miR-146a, and miR-155 genes contribute to the severity of COVID-19, justifying further investigation of gene-gene interactions in the pathogenesis of coronavirus infection.
7. Сравнительная характеристика сообществ листовёрток (Lepidoptera: Tortricidae) Азово-Егорлыкского и Приазовского ботанико-географических районов Ростовской области
   Святоха А. М. Шидловская Л. Г. Мижерицкая А. Р. Слюнькова В. Г. Романчук Р. В.
   Резюме Abstract | Скачать
   595.782

   В работе представлены результаты изучения сообществ бабочек-листовёрток (Tortricidae) двух ботанико-географических районов (БГР) Ростовской области: Азово-Егорлыкского и Приазовского. В Азово-Егорлыкском выявлено 914 экземпляров 75 видов, из которых 28 (37%) относятся к подсемейству Tortricinae, а 47 (63%) – к Olethreutinae. В Приазовском выявлено 5812 экземпляров и 128 видов: 50 (40%) Tortricinae и 78 (60%) Olethreutinae. В обоих районах в подсемействе Tortricinae доминируют трибы Cochylini и Archipini, в Olethreutinae – Eucosmini и Grapholitini. Распределение видов по категориям обилия (очень редкие, редкие, обычные, массовые), по экологическим группам, по приуроченности к жизненным формам растений (доминанта – хортофаги, субдоминанта – дендрофаги), а также по хозяйственному значению (вредители леса и плодовых культур) в обоих БГР сходно. В Азово-Егорлыкском БГР наиболее разнообразный тип местообитаний – плодово-ягодные сады, в Приазовском – древесно-кустарниковые заросли и закустаренные остепнённые склоны с оврагами. Кривые ассамблей показывают, что для плодово-ягодных садов и древесно-кустарниковых зарослей Азово-Егорлыкского БГР потенциальное видовое богатство выше выявленного; в Приазовском БГР кривая для древесно-кустарниковых насаждений достигла асимптоты (выявленное число близко к потенциальному), а для древесно-кустарниковых зарослей – нет.

   10.18522/2308-9709-2026-55-16

   This paper presents the results of a study on leafroller moth (Tortricidae) communities in two botanical–geographical regions (BGRs) of Rostov Oblast: the Azovo-Egorlyksky and the Priazovsky regions. In the Azovo-Egorlyksky region, 914 specimens belonging to 75 species were recorded, of which 28 species (37%) belong to the subfamily Tortricinae and 47 species (63%) to Olethreutinae. In the Priazovsky region, 5812 specimens and 128 species were recorded: 50 species (40%) of Tortricinae and 78 species (60%) of Olethreutinae. In both regions, the tribes Cochylini and Archipini dominate within Tortricinae, while Eucosmini and Grapholitini dominate within Olethreutinae. The distribution of species by abundance categories (very rare, rare, common, abundant), by ecological groups, by association with plant life forms (dominant: chortophages; subdominant: dendrophages), and by economic importance (pests of forests and fruit crops) is similar in both regions. In the Azovo-Egorlyksky region, the most diverse habitat type is fruit and berry gardens; in the Azov region, the most diverse habitats are tree–shrub thickets and shrubby steppe slopes with ravines. Species–accumulation curves show that for fruit–berry gardens and tree–shrub thickets in the Azovo-Egorlyksky region, the potential species richness is higher than the recorded richness; in the Priazovsky region, the curve for tree–shrub plantations has reached an asymptote (recorded species number close to potential), while for tree–shrub thickets it has not.
8. Состав и источники происхождения полициклических ароматических углеводородов в почвах бывшего хранилища жидких промышленных стоков
   Попов В. Р. Минкина Т. М. Сушкова С. Н. Барбашев А. И. Дудникова Т. С.
   Резюме Abstract | Скачать
   631.45

   По окончанию эксплуатации пруды-шламонакопители являются вторичным источником загрязнения сопредельных сред. С использованием высокоэффективной жидкостной хроматографиии изучено содержание 12 приоритетных ПАУ в почвах бывшего шламонакопителя, расположенного в пойме р. Северский Донец, в пределах осушенного озера Атаманское. Показано, что медианное суммарное содержание ПАУ составляет 5520 нг/г, превышая фоновые значения в 16 раз. Почвы характеризуются чрезвычайно опасным уровнем загрязнения, а наибольший вклад в загрязнения вносят бенз(b)флуорантен, бенз(k)флуорантен, и дибенз(g,h,i)перилен.

   10.18522/2308-9709-2026-55-15

   After the operation complete, sludge reservoirs become secondary sources of pollution for adjacent environments. Using high-performance liquid chromatography, the content of 12 priority PAHs was studied in the soils of a former sludge reservoir located in the floodplain of the Seversky Donets River, within the drained Lake Atamanskoe area. It was shown that the median total PAH content is 5520 ng/g, exceeding background values by 16 times. The soils are characterized by an extremely hazardous level of contamination, with the greatest contribution to pollution made by benzo(b)fluoranthene, benzo(k)fluoranthene, and dibenzo(g,h,i)perylene.
9. Изучение локусов длинных некодирующих РНК, ассоциированных с долголетием по результатам полногеномных исследований (GWAS)
   Столярова Т. П. Шкурат Т. П.
   Резюме Abstract | Скачать
   575.22

   Цель исследования — систематизировать GWAS-значимые локусы длинных некодирующих РНК, ассоциированных с продолжительностью жизни, долголетием родителей и биомаркерами старения у человека. Данные были отобраны из GWAS каталога и библиографических баз данных с использованием критерия значимости на уровне всего генома p ≤ 5 × 10⁻⁸. Для каждого локуса оценивали ассоциированный признак, эффект-аллель, численность выборки, этническое происхождение участников и уровень доказательности с долголетием. Наиболее убедительными локусами гена CDKN2B-AS1 длинной некодирующей РНК являются rs1556516-G; rs1556516-G; rs1333042-A; rs7859727-C ассоцированные с долголетием. Локусы rs12696304-G гена TERC и rs75517899-C гена MIR31HG имеют сильную биологическую значимость при оценке долголетия, но их вклад следует интерпретировать преимущественно как длину теломер и эпигенетический возраст.

   10.18522/2308-9709-2026-55-14

   The aim of the study was to systematize GWAS-significant loci of long non-coding RNAs associated with life expectancy, parental longevity and biomarkers of aging in humans. Data were selected from the GWAS catalog and bibliographic databases using the significance criterion at the whole-genome level p ≤ 5 × 10⁻⁸. For each locus, the associated trait, allele effect, sample size, ethnic origin of the participants and the level of evidence with longevity were estimated. The most convincing loci of the CDKN2B-AS1 long non-coding RNA gene are rs1556516-G; rs1556516-G; rs1333042-A; rs7859727-C, which are associated with longevity. The rs12696304-G locus of the TERC gene and the rs75517899-C locus of the MIR31HG gene have strong biological significance in assessing longevity, but their contribution should be interpreted primarily as telomere length and epigenetic age.
10. Молекулярно-генетические основы нерибосомального синтеза пептидов у прокариот
    Куликов М. П.
    Резюме Abstract | Скачать
    579.25; 577.21

    Нерибосомальный синтез – важный механизм продукции биоактивных метаболитов бактерий и грибов. Многие известные человечеству антибиотики синтезируются микроорганизмами именно с его помощью. Создание новых продуцентов нерибосомальных продуктов является актуальной, но весьма непростой задачей, поскольку генетические механизмы данного типа синтеза достаточно сложны. Конечный продукт производится ферментными комплексами, которые кодируются кластерами генов с определенной типичной структурой, которую можно идентифицировать биоинформатическими методами. В данном обзоре представлены современные знания о молекулярно-генетических основах кодирования и функционирования бактериальных нерибосомальных пептидсинтетаз, включая детальное описание структуры и механизмов работы как основных каталитических доменов, так и дополнительных, включая некаталитические. Рассмотрены типы архитектурной организации нерибосомальных пептидсинтетаз, а также механизмы их транскрипционной регуляции через глобальные регуляторы спорообразования и стрессового ответа у бактерий. Описаны основные способы практического применения бактериальных нерибосомальных пептидов в медицине и сельском хозяйстве.

    10.18522/2308-9709-2026-55-13

    Nonribosomal synthesis is an important mechanism for the production of bioactive metabolites in bacteria and fungi. Many antibiotics known to humankind are synthesized by microorganisms precisely by this mechanism. The creation of new producers of nonribosomal products is a relevant but highly challenging task, since the genetic mechanisms of this type of synthesis are rather complex. The final product is generated by enzymatic complexes encoded by gene clusters with a characteristic structural organization that can be identified using bioinformatic approaches. This review summarizes current knowledge on the molecular genetic basis of encoding and functioning of bacterial nonribosomal peptide synthetases, including a detailed description of the structure and mechanisms of action of both the core catalytic domains and additional, including noncatalytic, domains. Types of architectural organization of nonribosomal peptide synthetases are considered, as well as mechanisms of their transcriptional regulation via global regulators of sporulation and stress response in bacteria. The main strategies for practical application of bacterial nonribosomal peptides in medicine and agriculture are described.
11. Характеристика Южно-Предгорной зоны Краснодарского края: геолого-геоморфологический аспект
    Алейник В. В. Осипов А. В. Слюсарев В. Н.
    Резюме Abstract | Скачать
    631.423.1 (470.620)

    В статье рассматриваются геолого-геоморфологические особенности Южно-Предгорной зоны Краснодарского края на примере территории Северского района. Выполнен анализ трех основных геоморфологических областей: дельтово-пойменной области Кубани (Прикубанские плавни), Закубанской наклонной равнины и северо-западного окончания Кавказского поднятия. Подробно охарактеризована литогенная основа территории, представленная аллювиальными и делювиальными отложениями различного гранулометрического состава — от песков и супесей до тяжелых глин. Описано влияние рельефа и почвообразующих пород на формирование гидрологических условий и структуры почвенного покрова. Отражены последствия антропогенного воздействия (осушительная мелиорация, рисоводство) на трансформацию первичных форм рельефа в низменной части региона. Установлено, что сложность и неоднородность геоморфологического строения предгорий определяют разнообразие почвенных типов и активное развитие эрозионных процессов.

    10.18522/2308-9709-2026-55-12

    The article examines the geological and geomorphological features of the Southern Foothill zone of the Krasnodar Territory on the example of the territory of the Seversky district. The analysis of three main geomorphological regions is carried out: the Kuban delta-floodplain region (Prikuban plavni), the Transcuban inclined plain and the northwestern end of the Caucasian uplift. The lithogenic basis of the territory, represented by alluvial and deluvial deposits of various granulometric composition, from sands and sandy loams to heavy clays, is described in detail. The influence of relief and soil-forming rocks on the formation of hydrological conditions and the structure of the soil cover is described. The effects of anthropogenic impact (drainage reclamation, rice farming) on the transformation of primary landforms in the lowland part of the region are reflected. It is established that the complexity and heterogeneity of the geomorphological structure of the foothills determine the diversity of soil types and the active development of erosion processes.
12. Типулоидные насекомые (Insecta : Diptera : Tipulidae) бассейна реки Терек (Кабардино-Балкарская Республика)
    Якимов А. В. Шаповалов М. И. Шорова Д. Х.
    Резюме Abstract | Скачать
    591.9:595.7:595.77(470.64)

    Работа посвящена типулоидным насекомым (Insecta : Diptera : Tipulidae) бассейна реки Терек в пределах Кабардино-Балкарской Республики. Типулоидные насекомые – важнейшие представители зообентоса речных экосистем Северокавказского региона. Не смотря на изученность видового состава (по имаго) региональной фауны, ларвальные стадии развития остаются практически не исследованы. Цель работы – изучить видовой состав, структуру, распространение, биотопическую приуроченность и значение ларвальных стадий развития комаров-долгоножек (Tipulidae) в различных водотоках КБР. Впервые составлен перечень видов комаров-долгоножек Кабардино-Балкарии, ларвальные стадии развития которых приурочены к различным водотокам республики. Сборами охвачены ледниковые реки, малые и сверхмалые реки, речки и родниковые ручьи от равнины (180 м над ур. м) до высокогорной (3500 м над ур. м) зоны республики (Терек, Малка, Баксан, Чегем, Нальчик, Шалушка, Кенже и другие). В статье приведены подробные оригинальные описания мест сбора комаров-долгоножек. При сборе типулид и их камеральной обработке были использованы унифицированные классические методики исследований. Упор сделан на сборе взрослых ларвальных стадий развития. Произведены качественные и количественные сборы, в последнем случае при помощи бентометра Садовского. Идентификация видов комаров-долгоножек произведена с использованием соответствующих определительных таблиц и атласов, в том числе и современных. В работе указаны места сбора личинок комаров-долгоножек, иллюстрированные соответствующими фотографиями. На основании собранного гидробиологического материала и его таксономической обработки в гидроэкосистемах КБР установлено обитание 23 валидных вида комаров-долгоножек. Составлены подробные описания стаций переживания этих насекомых. Приведены особенности биологии и экологии выявленных видов комаров-долгоножек. Даны показатели относительной численности и биомассы личиночных стадий развития. Указаны представители различных зоогеографических групп этих насекомых. Показана роль комаров-долгоножек в гидроэкосистемах исследуемого региона.

    10.18522/2308-9709-2026-55-11

    The work is devoted to the Tipuloid insects (Insecta : Diptera : Tipulidae) of the Terek River basin within the Kabardino-Balkarian Republic. Tipuloid insects are the most important representatives of the zoobenthos of the river ecosystems of the North Caucasus region. Despite the study of the species composition (based on the imago) of the regional fauna, the larval stages of development remain almost unexplored. The aim of the work is to study the species composition, structure, distribution, biotopic affinity and significance of larval stages of development of long-legged mosquitoes (Tipulidae) in various watercourses of the KBR. For the first time, a list of species of long-legged mosquitoes of Kabardino-Balkaria, larval stages of development of which are confined to various watercourses of the republic, is compiled. The study covers glacial rivers, small and ultra-small rivers, streams, and spring-fed streams from the plain (180 m above sea level) to the high-mountain zone (3,500 m above sea level) of the republic (Terek, Malka, Baksan, Chegem, Nalchik, Shalushka, Kenzhe, and others). The article provides detailed descriptions of the locations where long-horned mosquitoes were collected. The study used standardized classical research methods for collecting and processing the mosquitoes. The emphasis is on the collection of adult larval stages of development. Qualitative and quantitative collections have been made, in the latter case using Sadovsky's bentometer. The identification of long-legged mosquito species has been carried out using relevant identification tables and atlases, including modern ones. The work includes the locations where long-legged mosquito larvae were collected, accompanied by relevant photographs. Based on the collected hydrobiological material and its taxonomic processing, 23 valid species of long-legged mosquitoes have been identified in the hydroecosystems of the KBR. Detailed descriptions of the habitats of these insects have been compiled. The biology and ecology of the identified species of long-legged mosquitoes have been described. The relative abundance and biomass of the larval stages have been provided. Representatives of various zoogeographical groups of these insects have been identified. The role of long-legged mosquitoes in the hydroecosystems of the study region has been demonstrated.
13. Таксономическая организация и экологическое разнообразие сообществ листовёрток (Lepidoptera: Tortricidae) Долины Нижнего Дона
    Святоха А. М. Шидловская Л. Г. Мижерицкая А. Р. Слюнькова В. Г. Романчук Р. В.
    Резюме Abstract | Скачать
    595.782

    В работе представлены результаты изучения сообществ бабочек листовёрток (Tortricidae) Долины Нижнего Дона (Ростовская область). Выявлено 115 видов бабочек из 2 подсемейств и 11 триб (по итогам составлен аннотированный список). Из этого числа 52 вида (45 %) имеют хозяйственное значение. Преобладают лесные мезофильные виды (49 видов, 36 %), что соотносится с присутствием в выборке 14 видов вредителей леса (12 %), 14 видов вредителей плодовых культур (12%), а также 55 видов (48%) хортофагов и 28 видов (24 %) дендрофагов. По широте трофических связей доминируют полифаги – 46 видов (40 %). Основу трофического спектра составляют растения семейств Asteraceae, Rosaceae, Fagaceae, Salicaceae и Betulaceae, среди которых много культурных видов. К наиболее обильным хозяйственно значимым видам отнесены: Aleimma loeflingiana, Archips rosana, Hedya nubiferana, Aspila funebrana, Cydia pomonella. Наибольшее число выявлений и самая высокая плотность популяций указанных видов отмечается на участках с древесно-кустарниковыми зарослями, а также в населённых пунктах, на территории и в окрестностях которых имеются сады. Наиболее высокий уровень сходства сообществ листовёрток демонстрируют заливные луга и огороды. Максимальное видовое разнообразие отмечено в пойменных и лесных местообитаниях. Байрачные и низинные леса, а также водно-болотные угодья (берега водоёмов) представляют собой местообитания с высоким потенциальным видовым богатством. Эти природные комплексы наиболее далеки от исчерпания видового состава и являются самыми перспективными для дальнейшего изучения.

    10.18522/2308-9709-2026-55-10

    This paper presents the results of a study on tortricid moth communities (Tortricidae) in the Lower Don Valley (Rostov Oblast). A total of 115 moth species belonging to 2 subfamilies and 11 tribes were recorded, and an annotated checklist has been compiled. Of these, 52 species (45 %) are of economic importance. Forest mesophilic species predominate (49 species, 36 %), which correlates with the presence in the samples of 14 species of forest pests (12 %), 14 species of fruit crop pests (12 %), as well as 55 species (48%) of chortophages and 28 species (24 %) of dendrophages. In terms of trophic breadth, polyphages dominate, accounting for 46 species (40 %). The trophic spectrum is primarily based on plants from the families Asteraceae, Rosaceae, Fagaceae, Salicaceae, and Betulaceae, many of which are cultivated species. The most abundant economically significant species include Aleimma loeflingiana, Archips rosana, Hedya nubiferana, Aspila funebrana, and Cydia pomonella. The highest number of occurrences and the highest population density of these species were recorded in areas with shrub thickets, as well as in populated localities with orchards within their boundaries or in their vicinity. The highest level of similarity in tortricid communities was observed between floodplain meadows and kitchen gardens. Maximum species diversity was noted in floodplain and forest habitats. Ravine and low-lying forests, as well as wetlands (waterbody shores), represent habitats with high potential species richness. These natural complexes are the furthest from being fully inventoried and are the most promising targets for further study.
14. Управление инвазивными чужеродными видами древесных растений в степной зоне юга Европейской России (на примере Ростовской области)
    Дмитриев П. А. Федоринова О. И. Дмитриева А. А. Козловский Б. Л. Куропятников М. В.
    Резюме Abstract | Скачать
    581.93 (470.61-25)

    Распространение древесных инвазивных чужеродных видов (ИЧВ) в травянистых экосистемах значительно изменяет их структуру и функционирование и стало серьезной экологической проблемой во всем мире. Поэтому разработка региональной стратегии управления древесными ИЧВ в степной зоне юга Европейской России, учитывающей экологические, социальные и экономические особенности региона, является актуальной задачей. На настоящий момент в границах Ростовской области зафиксировано 24 ИЧВ. Предложена принципиальная схема управления ИЧВ в степной зоне юга России, учитывающая зональную специфику процесса инвазии. Для Acer negundo, Ailanthus altissima, Amorpha fruticosa и Halimodendron halodendron предложена политика искоренения. Для остальных ИЧВ рекомендуется политика сдерживания избирательная по отношению к растительным сообществам. Отмечается, что реализация политики управления конкретным ИЧВ должна опираться на объективную оценку баланса экологического и экономического ущерба от его инвазии и эффекта экосистемных услуг от его культуры. Быть обеспечена финансовыми, технологическими и человеческими ресурсами, а также иметь обоснованные гарантии достижения поставленной цели.

    10.18522/2308-9709-2026-55-9

    The spread of woody invasive alien species (IAS) in grassland ecosystems significantly alters their structure and functioning and has become a serious environmental problem worldwide. Therefore, developing a regional strategy for managing woody IAS in the steppe zone of southern European Russia, taking into account the ecological, social, and economic characteristics of the region, is a pressing issue. Currently, 24 IAS have been identified within the Rostov Region. A conceptual framework for managing IAS in the steppe zone of southern Russia is proposed, taking into account the zonal specificity of the invasion process. An eradication policy is proposed for Acer negundo, Ailanthus altissima, Amorpha fruticosa, and Halimodendron halodendron. For the remaining IAS, a containment policy, selective for plant communities, is recommended. It is noted that the implementation of a management policy for a specific IAS should be based on an objective assessment of the balance of ecological and economic damage from its invasion and the ecosystem service benefits of its cultivation. Be provided with financial, technological and human resources, and also have reasonable guarantees of achieving the set goal.
15. Тканеспецифическая экспрессия генов дегидринов у Quercus robur L. в ответ на засуху
    Олейников А. А. Крылов П. А.
    Резюме Abstract | Скачать
    575

    Дуб черешчатый (Quercus robur L.), является одной из основных лесообразующих пород лесостепной зоны, подверженных воздействию широкого спектра абиотических стрессов, среди которых наиболее значимым негативным фактором является засуха, ограничивающая его рост и развитие. Несмотря на значимость вида, молекулярные механизмы его адаптации, в частности роль белков позднего эмбриогенеза, а именно дегидринов, остаются недостаточно изученными в контексте тканеспецифического ответа. В связи с этим целью данного исследования стала оценка дифференциальной экспрессии дегидринов у Q. robur, участвующих в ответе на водный дефицит, путем анализа данных РНК-секвенирования для трёх типов тканей: листьев, боковых и стержневых корней. Анализ данных RNA-seq производился с помощью DESeq2. Построенные матрицы дифференциальной экспрессии дегидринов у Q. robur показали наличия ярко выраженной тканеспецифичности. В боковых и стержневых корнях повысилась экспрессия дегидринов типов K₁₄, SK₃, Y₂SK₂ и Y₂K₇, а в листьях – Y₂SK₂, Y₂K₇, SK₂. Построенные тепловые карты подтвердили наличие чётких паттернов тканеспецифической экспрессии. В целом, наиболее высокая индукция экспрессии наблюдалась для дегидринов типов Y₂SK₂, Y₂K₇ и K₁₄ в корнях и SK₂ в листьях, что может указывать на их ключевую роль в адаптации Q. robur к засухе.

    10.18522/2308-9709-2026-55-8

    English oak (Quercus robur L.) is one of the main forest-forming species in the forest-steppe zone, subject to a wide range of abiotic stresses, among which drought is the most significant negative factor, limiting its growth and development. Despite the species' importance, the molecular mechanisms of its adaptation, in particular the role of late embryogenesis abundant (LEA) proteins, namely dehydrins, remain insufficiently studied in the context of tissue-specific response. Therefore, the aim of this study was to assess the differential expression of dehydrins in Q. robur involved in the response to water deficit by analyzing RNA-sequencing data for three tissue types: leaves, lateral roots, and taproots. RNA-seq data analysis was performed using DESeq2. The constructed differential expression matrices for dehydrins in Q. robur revealed pronounced tissue specificity. In lateral and taproots, the expression of K₁₄, SK₃, Y₂SK₂, and Y₂K₇ type dehydrins increased, while in leaves, the expression of Y₂SK₂, Y₂K₇, and SK₂ types increased. The constructed heatmaps confirmed clear patterns of tissue-specific expression. Overall, the highest induction of expression was observed for Y₂SK₂, Y₂K₇, and K₁₄ type dehydrins in roots and for SK₂ in leaves, which may indicate their key role in the adaptation of Q. robur to drought.
16. Генетические варианты IL-6 (rs1800795) и CYP3A4 (rs2740574) как предикторы тяжести течения коронавирусной инфекции COVID-19
    Этингер С. М. Затонский С. А. Григорян Н. А. Иванова Е. С. Бутенко Е. В.
    Резюме Abstract | Скачать
    575

    Введение. Течение COVID-19 варьирует от бессимптомного до критического, что определяется комплексом факторов, включая генетическую предрасположенность. Гены, кодирующие провоспалительные цитокины и ферменты метаболизма ксенобиотиков, являются кандидатами, модулирующими ответ организма на вирус SARS-CoV-2. Цель. Исследовать ассоциацию полиморфных локусов генов IL-6 (rs1800795), СYP3A4 (rs2740574), CYP2D6 (rs1065852), CYP3A4 (rs28371759), CYP2D6 (rs3892097), CYP3A5(rs776746), CYP1A2 (rs2069522) у пациентов с различной тяжестью течения коронавирусной инфекции COVID-19 Материалы и методы. В исследование включено 217 пациентов, перенесших COVID-19, разделенных на группы легкого (n=113) и тяжелого (n=104) течения коронавирусной инфекции. Проведено генотипирование методом аллель-специфичной ПЦР. Статистический анализ выполнен с использованием U-критерия Манна–Уитни, критерия χ² Пирсона и расчета отношения шансов. Результаты. Пациенты группы тяжелого течения были старше (55,1±11,1 vs. 46,0±15,1 года, p<0,001) и имели более высокий ИМТ (29,2±5,1 vs. 25,6±5,0 кг/м², p<0,001). Установлена ассоциация полиморфизма IL-6 rs1800795 с тяжестью COVID-19: аллель G чаще встречался в группе тяжелого течения (70,2% vs. 52,7%, OR=2,11, p<0,001), аллель C — в группе легкого течения (47,3% vs. 29,8%, OR=0,47, p<0,001). Для полиморфизма CYP3A4 rs2740574 генотип AA чаще встречался в группе тяжелого течения (90,4% vs. 78,8%, OR=2,53, p=0,018), тогда как носительство аллеля G было значительно выше в группе легкого течения (21,2% vs. 9,6%, OR=0,39, p=0,018). Для CYP1A2 (rs2069522), CYP3A4 (rs28371759), CYP2D6 (rs1065852, rs3892097) и CYP3A5 (rs776746) значимых различий не выявлено. Заключение. Генетические варианты IL-6 rs1800795 и CYP3A4 rs2740574 являются значимыми предикторами тяжести COVID-19 и могут быть использованы для стратификации пациентов по риску развития тяжелых форм заболевания.

    10.18522/2308-9709-2026-55-7

    Introduction. The clinical course of COVID-19 ranges from asymptomatic to critical, which is determined by a combination of factors, including genetic predisposition. Genes encoding proinflammatory cytokines and xenobiotic-metabolizing enzymes are candidates that modulate the host response to SARS-CoV-2. Objective. To investigate the association of polymorphic loci of the IL-6 (rs1800795), CYP3A4 (rs2740574), CYP2D6 (rs1065852), CYP3A4 (rs28371759), CYP2D6 (rs3892097), CYP3A5 (rs776746), and CYP1A2 (rs2069522) genes in patients with varying severity of COVID-19. Materials and methods. The study included 217 patients who had recovered from COVID-19, divided into mild (n=113) and severe (n=104) disease groups. Genotyping was performed using allele-specific PCR. Statistical analysis was carried out using the Mann–Whitney U test, Pearson’s chi-squared test, and odds ratio calculation. Results. Patients in the severe group were older (55.1±11.1 vs. 46.0±15.1 years, p<0.001) and had a higher BMI (29.2±5.1 vs. 25.6±5.0 kg/m², p<0.001). An association of the IL-6 rs1800795 polymorphism with COVID-19 severity was found: the G allele was more frequent in the severe group (70.2% vs. 52.7%, OR=2.11, p<0.001), while the C allele was more frequent in the mild group (47.3% vs. 29.8%, OR=0.47, p<0.001). For the CYP3A4 rs2740574 polymorphism, the AA genotype was more frequent in the severe group (90.4% vs. 78.8%, OR=2.53, p=0.018), whereas carriage of the G allele was significantly higher in the mild group (21.2% vs. 9.6%, OR=0.39, p=0.018). No significant differences were found for CYP1A2 (rs2069522), CYP3A4 (rs28371759), CYP2D6 (rs1065852, rs3892097), or CYP3A5 (rs776746). Conclusion. The genetic variants IL-6 rs1800795 and CYP3A4 rs2740574 are significant predictors of COVID-19 severity and can be used to stratify patients according to the risk of developing severe forms of the disease.
17. Изучение локусов, ассоциированных с долголетием по результатам полногеномных ассоциативных исследований (GWAS).
    Столярова Т. П. Шкурат Т. П.
    Резюме Abstract | Скачать
    575

    Целью данной работы является изучение локусов, ассоциированных с долголетием человека по результатам полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) в различных популяциях. Анализ крупных общегеномных ассоциативных исследований (GWAS) привел к выявлению некоторых генов, потенциально ассоциированных со старением. Проведенный анализ крупных полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) позволил подтвердить ассоциацию с продолжительностью жизни полиморфных вариантов в гене, кодирующем аполипопротеин Е (APOE).

    10.18522/2308-9709-2026-55-6

    The aim of this work is to study loci associated with human longevity based on the results of genome-wide association studies (GWAS) in various populations. The analysis of large-scale genome-wide association studies (GWAS) led to the identification of some genes potentially associated with aging. The analysis of large-scale genome-wide association studies (GWAS) allowed to confirm the association with life expectancy of polymorphic variants in the gene encoding apolipoprotein E (APOE).
18. Иммуногенетические предикторы атерогенеза: холестерин причина или следствие…?
    Байдалакова И. В. Гладенький А. А. Цикуниб М. Р. Пчелинцев М. И. Богус А. А. Ашканова Т. М. Лысенков С. П. Муженя Д. В. Джанхот Р. К. Ачох З. З. Тугуз А. Р. Шумилов Д. С.
    Резюме Abstract | Скачать
    616.13

    Введение: Сердечно-сосудистые заболевания остаются ведущей причиной преждевременной смертности, несмотря на антихолестериновую профилактику и применение статинов. Традиционная холестериновая теория атерогенеза, восходящая к работам Н.Н. Аничкова, подвергается критическому пересмотру в свете данных молекулярной биологии и иммуногенетики. Цель: Оценить роль липопротеинов и их окисленных форм, медиаторов воспаления, NK-клеток и генетических полиморфизмов в инициировании и прогрессировании атеросклероза. Методы: Анализ литературы (1921–2024 гг.), включая метаанализы, международные обзоры, экспериментальные данные, а также собственные результаты генотипирования 910 жителей Республики Адыгея (475 доноров, 435 пациентов с ЦВА/ИБС). Определяли связь SNP генов цитокинов IL-1β, IL-17A, TNF-α, IL-4 с продукцией медиаторов воспаления. Результаты: Ключевым фактором атерогенеза являются не липопротеины низкой плотности (ЛПНП), а их окисленные модификации (окЛПНП), активно поглощаемые макрофагами через рецепторы-мусорщики. Воспалительные цитокины (IL-1β, IL-17A, TNF-α) и молекулы адгезии индуцируют трансформацию макрофагов и гладкомышечных клеток в пенистые клетки. NK-клетки способны ограничивать прогрессирование атеросклероза, однако дисбаланс их субпопуляций поддерживает хроническое воспаление. Генетический анализ выявил ассоциацию SNP IL-1β (511С), IL-17A (197А), TNF-α (308G), IL-4 (589Т) с повышенным риском ИБС и ЦВА (OR 2,45–4,67; p<0,05). У больных ИБС и ЦВА отмечена гиперпродукция провоспалительных цитокинов в культуре МНК по сравнению с донорами, при сниженной активности NK-клеток. Заключение: Атерогенез является многофакторным процессом, в котором решающую роль играют иммуновоспалительные механизмы и генетическая предрасположенность. Холестерин и ЛПНП не выступают триггерами, а инициаторами служат их окисленные формы, взаимодействующие с клетками иммунной системы. SNP генов провоспалительных цитокинов определяют гиперпродукцию медиаторов и предрасположенность к ССЗ. Выявленные иммуногенетические маркеры могут использоваться для персонализированной оценки риска и профилактики атеросклероза.

    10.18522/2308-9709-2026-55-5

    Introduction: Cardiovascular diseases remain the leading cause of premature mortality despite lipid-lowering prevention and the widespread use of statins. The traditional cholesterol theory of atherogenesis, originating from the works of N.N. Anichkov, is undergoing critical reassessment in light of data from molecular biology and immunogenetics. Objective: To evaluate the role of lipoproteins and their oxidized forms, inflammatory mediators, NK cells, and genetic polymorphisms in the initiation and progression of atherosclerosis. Methods: A literature analysis (1921–2024) was conducted, including meta-analyses, international reviews, experimental data, as well as original genotyping results of 910 residents of the Republic of Adygea (475 donors, 435 patients with cerebrovascular disease (CVD) / coronary heart disease (CHD)). Associations of cytokine gene SNPs (IL-1β, IL-17A, TNF-α, IL-4) with the production of inflammatory mediators were assessed. Results: The key factor in atherogenesis is not low-density lipoproteins (LDL), but their oxidized modifications (oxLDL), which are actively taken up by macrophages via scavenger receptors. Proinflammatory cytokines (IL-1β, IL-17A, TNF-α) and adhesion molecules induce the transformation of macrophages and smooth muscle cells into foam cells. NK cells are capable of limiting the progression of atherosclerosis; however, an imbalance of their subpopulations sustains chronic inflammation. Genetic analysis revealed an association of SNPs IL-1β (511C), IL-17A (197A), TNF-α (308G), and IL-4 (589T) with an increased risk of CHD and cerebrovascular disease (OR 2.45–4.67; p<0.05). In patients with CHD and cerebrovascular disease, hyperproduction of proinflammatory cytokines in mononuclear cell cultures was observed compared with donors, along with reduced NK cell activity. Conclusion: Atherogenesis is a multifactorial process in which immunoinflammatory mechanisms and genetic predisposition play a decisive role. Cholesterol and LDL are not triggers; the initiators are their oxidized forms interacting with immune system cells. SNPs of proinflammatory cytokine genes determine hyperproduction of mediators and susceptibility to CVD. The identified immunogenetic markers may be used for personalized risk assessment and prevention of atherosclerosis.
19. Влияние засухи на транскрипционную активность DREB2A, AAO, rbcL и физиолого-биохимические характеристики дуба черешчатого (Quercus robur L.)
    Малов В. О. Зыбинская П. А. Крылов П. А. Третьякова А. В.
    Резюме Abstract | Скачать
    575.2:574.2

    Борьба с засухой является одной из важнейших задач в мире, особенно для южных регионов России. Для снижения негативного влияния засухи используются агролесомелиоративные мероприятия, включающие формирование устойчивых фитоценозов. Одним из основных лесообразующих видов является дуб черешчатый (Quercus robur L.), чьи молекулярно-генетические механизмы устойчивости к засухе недостаточно изучены. Нами изучены реакции сеянцев Q. robur на засуху путем оценки морфологических, физиологических параметров и транскрипционной активности генов: транскрипционного фактора DRE-связывающий белок 2A (DREB2A), большой субъединицы рибулозо-1,5-бисфосфаткарбоксилазы/оксигеназы (rbcL) и гена абсцизной альдегидоксидазы (AAO). Показано, что при постоянном поливе активность генов DREB2A, rbcL и AAO не изменялась. При моделируемой засухе относительная экспрессия DREB2A резко повышалась на первой неделе эксперимента, а затем снижалась, в то время как экспрессия rbcL и AAO постепенно увеличивалась ко второй неделе эксперимента. Это может указывать на то, что у древесных растений, в частности у Q. robur, на начальных этапах действия засухи запускаются ABA-независимые механизмы, а при длительном стрессе — ABA-зависимые механизмы, требующие энергии, в обеспечении которой важную роль выполняет цикл Кальвина. В ответ на засуху у сеянцев наблюдалось увеличение содержания антоцианов и флавонолов и снижение содержания хлорофиллов, а также индекса азотного баланса. На начальных этапах действия засухи выявлена отрицательная корреляция между транскрипционной активностью DREB2A и содержанием флавонолов, а на поздних этапах — между активностью DREB2A и содержанием хлорофиллов в листьях. Полученные результаты частично раскрывают возможные механизмы адаптации Q. robur к условиям засухи, которые могут лечь в основу его молекулярной селекции.

    10.18522/2308-9709-2026-55-4

    Fighting against drought is one of the most important tasks in the world, especially for the Southern regions of Russia. To mitigate the negative impact of drought, agroforestry measures are used, which include the formation of stable phytocenoses. One of the key forest-forming species is pedunculate oak (Quercus robur L.), whose molecular-genetic mechanisms of drought resistance are insufficiently studied. We studied the reactions of Q. robur seedlings to drought by evaluating morphological, physiological parameters, and the transcriptional activity of the genes: the transcription factor DRE-binding protein 2A (DREB2A), the large subunit of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (rbcL) and the abscisic aldehyde oxidase (AAO). The study revealed that the activity of the rbcL, DREB2A, and AAO genes did not change under constant watering. Under simulated drought, the relative expression of DREB2A increased sharply in the first week of the experiment and then decreased, while the expression of rbcL and AAO gradually increased by the second week of the experiment. This may indicate that in woody plants, particularly in Q. robur, drought conditions initially activate ABA-independent mechanisms and, under prolonged stress, ABA-dependent mechanisms that require energy, in which the Calvin cycle plays a significant role. In response to drought, Q. robur seedlings showed an increase in the anthocyanin and flavоnol content and a decrease in chlorophyll, as well as in the nitrogen balance index. Correlation analysis revealed an inverse correlation between the transcriptional activity of DREB2A with the flavonol content at the initial stages of the drought, and at the later stages — with chlorophyll content in the Q. robur leaves. The results obtained partially reveal the possible mechanisms of Q. robur adaptation to drought conditions, which can form the basis of its molecular breeding.
20. Таксономический и биоморфологический анализ флоры кладбищ Ростовской агломерации
    Лукьянова О. П. Ермолаева О. Ю. Казеев К. Ш.
    Резюме Abstract | Скачать
    581.9; 574.4; 581.5

    В статье впервые представлены результаты сравнительного исследования флоры восьми кладбищ городов Ростова-на-Дону и Батайска. Выявлено 225 видов сосудистых растений, относящихся к 181 роду и 70 семействам. Установлено, что основу флоры составляют травянистые растения (68,4 %), а ведущими семействами являются Asteraceae, Rosaceae и Poaceae. Показано, что старые некрополи (Нижне-Гниловское, Верхне-Гниловское) отличаются максимальным видовым богатством и служат резерватами для аборигенных видов. Выявлен ряд инвазионных видов (Ambrosia artemisiifolia, Ailanthus altissima, Acer negundo), представляющих угрозу для естественных экосистем. Отмечено низкое флористическое сходство (КС < 0,4; КЖ < 0,3) между некрополями двух городов, что свидетельствует о доминировании культигенной флоры и относительной изолированности их видовых комплексов.

    10.18522/2308-9709-2026-55-3

    The article presents for the first time the results of a comparative study of the flora of eight cemeteries in the cities of Rostov-on-Don and Bataysk. 225 species of vascular plants belonging to 181 genera and 70 families were identified. It was established that herbaceous plants (68.4 %) make up the basis of the flora, and the leading families are Asteraceae, Rosaceae, and Poaceae. It has been shown that the old necropolises (Nizhne-Gnilovskoye and Verkhne-Gnilovskoye) have the highest species richness and serve as reserves for native species. A number of invasive species (Ambrosia artemisiifolia, Ailanthus altissima, and Acer negundo) have been identified as a threat to natural ecosystems. There is a low floristic similarity (CS < 0.4; CJ < 0.3) between the necropolises of the two cities, which indicates the dominance of cultigenic flora and the relative isolation of their species complexes.
21. Обилие и таксономическое разнообразие прокариотных сообществ почвоподобных тел пещер Вьетнама
    Александрова А. В. Фам Т. Х. Князева А. В. Лысак Л. В. Косенко Н. Р.
    Резюме Abstract | Скачать
    579.26 : 631.46

    Проведенное исследование прокариотных сообществ почвоподобных тел (солоидов) пещер Вьетнама позволило выявить их микробиологическую специфику и значительное отличие от типичных зональных почв. Общая численность бактерий, длина актиномицетного мицелия и биомасса прокариот в исследованных солоидах были существенно ниже, чем в почвах, что коррелировало с содержанием общего углерода в условиях ограниченного поступления органического вещества из внешней среды. Выявлено высокое таксономическое разнообразие микробиомов солоидов при доминировании филумов Actinomycetota и Pseudomonadota. Наибольшие значения численности и разнообразия отмечены в солоидах пещеры Тханьван, что, вероятно, было связано с относительно высоким содержанием общего углерода. Филум Actinomycetota отличался наибольшим родовым богатством, что отражает его устойчивость к разнообразным стрессовым факторам среды, для других филумов родовое обилие на порядок ниже. Анализ экологических показателей (индексов Шеннона, Симпсона) подтвердил наибольшее α-разнообразие почвоподобных тел (ППТ) пещеры Тханьван. Сравнение микробиомов по метрике сходства Брея-Кертиса и анализ PCoA выявило обособленность сообщества почвоподобного тела пещеры Пигми и значительное сходство микробиомов всех солоидов с микробиотой листового опада, что указывает на занос микроорганизмов с поверхности воздушными и водными потоками. Проведенный иерархический кластерный анализ выявил разделение микробных сообществ на три группы, отражающие особенности их экотопов. Полученные данные о высоком филогенетическом разнообразии и таксономическом богатстве культивируемых бактериальных комплексов солоидов демонстрируют их возможную роль как депозитария прокариот и потенциального источника биотехнологически ценных штаммов.

    10.18522/2308-9709-2026-55-2

    The conducted study of prokaryotic communities of soil-like bodies (soloids) of caves in Vietnam allowed us to identify their microbiological specifics and significant differences from typical zonal soils. The total bacterial abundance, actinomycete mycelium length, and prokaryotic biomass in the investigated soloids were substantially lower than in soils, correlating with total organic carbon content under conditions of limited organic matter input from the external environment. The soloid microbiomes exhibited high taxonomic diversity dominated by the phyla Actinomycetota and Pseudomonadota. The highest bacterial abundance and diversity were recorded in the Thanvan Cave soloids, likely associated with a relatively high total carbon content. The phylum Actinomycetota showed the greatest genus-level richness, reflecting its resistance to diverse environmental stress factors, while for other phyla, genus abundance was an order of magnitude lower. Ecological indices (Shannon and Simpson) confirmed the highest α-diversity in the Thanvan Cave prokaryotic community. A comparison of microbiomes using the Bray–Curtis similarity metric and PCoA analysis revealed a distinct composition of the Pygmy Cave community and a pronounced similarity between all soloid microbiomes and leaf litter microbial assemblages, suggesting microbial input from the surface by air and water currents. The cluster analysis revealed the division of microbial communities into three groups reflecting the characteristics of their ecotopes. The obtained data on the high phylogenetic diversity and taxonomic richness of the cultivated bacterial complexes of soloids demonstrate their possible role as a prokaryotic depository and a potential source of biotechnologically valuable strains.
22. Влияние гуминовых удобрений на ростовые процессы озимой пшеницы при загрязнении медью
    Бесчетников В. В. Безуглова О. С.
    Резюме Abstract | Скачать
    631.4

    Для изучения изменений на клеточном уровне в растениях озимой пшеницы на начальных стадиях роста в условиях загрязнения ионами меди и применения гуминовых удобрений был проведен вегетационный эксперимент с использованием песчаной культуры и с питательной смесью Прянишникова. В статье представлены морфометрические и цитометрические наблюдения корней и листовых пластинок 14-дневных всходов озимой пшеницы (Triticum aestivum L., сорт ДонЭко). Результаты показывают, что исследованные гуминовые удобрения оказали положительное влияние на рост и развитие проростков в условиях медного стресса, эффективно смягчая воздействие токсиканта. Гуматы оказали существенное влияние на корневую систему растений: количество корней и их длина, причем и при сочетанном внесении гуматов с солью меди, и без нее. В то же время загрязнение медью приводит к существенным деформациям кортекса и стелы корня, а также изменению формы клеток эпиблемы. Данный токсический эффект снижается при внесении в субстрат гуминовых удобрений. Листовые пластины растений оказались менее подвержены воздействию избыточного содержания меди в субстрате, а их внешняя структура осталась на приемлемом уровне без существенных деформаций.

    10.18522/2308-9709-2026-55-1

    A pot experiment using a sand culture with Pryanishnikov’s nutrient mixture was conducted to study cellular-level changes in winter wheat plants during initial growth stages under copper ion contamination and the application of humic fertilizers. The article presents morphometric and cytometric observations of the roots and leaf blades of 14-day-old winter wheat seedlings (cv. DonEco). The results demonstrate that the tested humic fertilizers exerted a positive effect on seedling growth and development under copper stress, effectively mitigating the toxicant's impact. Humates significantly influenced the root system, increasing both root length and number regardless of copper presence. While copper contamination caused substantial deformations of the root cortex and stele, as well as alterations in epiblema cell shape, these toxic effects were reduced by the addition of humic fertilizers. The leaf blades were less susceptible to excess copper, maintaining their structural integrity without significant deformation.