579.26 : 631.46
Проведенное исследование прокариотных сообществ почвоподобных тел (солоидов) пещер Вьетнама позволило выявить их микробиологическую специфику и значительное отличие от типичных зональных почв. Общая численность бактерий, длина актиномицетного мицелия и биомасса прокариот в исследованных солоидах были существенно ниже, чем в почвах, что коррелировало с содержанием общего углерода в условиях ограниченного поступления органического вещества из внешней среды. Выявлено высокое таксономическое разнообразие микробиомов солоидов при доминировании филумов Actinomycetota и Pseudomonadota. Наибольшие значения численности и разнообразия отмечены в солоидах пещеры Тханьван, что, вероятно, было связано с относительно высоким содержанием общего углерода. Филум Actinomycetota отличался наибольшим родовым богатством, что отражает его устойчивость к разнообразным стрессовым факторам среды, для других филумов родовое обилие на порядок ниже. Анализ экологических показателей (индексов Шеннона, Симпсона) подтвердил наибольшее α-разнообразие почвоподобных тел (ППТ) пещеры Тханьван. Сравнение микробиомов по метрике сходства Брея-Кертиса и анализ PCoA выявило обособленность сообщества почвоподобного тела пещеры Пигми и значительное сходство микробиомов всех солоидов с микробиотой листового опада, что указывает на занос микроорганизмов с поверхности воздушными и водными потоками. Проведенный иерархический кластерный анализ выявил разделение микробных сообществ на три группы, отражающие особенности их экотопов. Полученные данные о высоком филогенетическом разнообразии и таксономическом богатстве культивируемых бактериальных комплексов солоидов демонстрируют их возможную роль как депозитария прокариот и потенциального источника биотехнологически ценных штаммов.
10.18522/2308-9709-2026-55-2
The conducted study of prokaryotic communities of soil-like bodies (soloids) of caves in Vietnam allowed us to identify their microbiological specifics and significant differences from typical zonal soils. The total bacterial abundance, actinomycete mycelium length, and prokaryotic biomass in the investigated soloids were substantially lower than in soils, correlating with total organic carbon content under conditions of limited organic matter input from the external environment. The soloid microbiomes exhibited high taxonomic diversity dominated by the phyla Actinomycetota and Pseudomonadota. The highest bacterial abundance and diversity were recorded in the Thanvan Cave soloids, likely associated with a relatively high total carbon content. The phylum Actinomycetota showed the greatest genus-level richness, reflecting its resistance to diverse environmental stress factors, while for other phyla, genus abundance was an order of magnitude lower. Ecological indices (Shannon and Simpson) confirmed the highest α-diversity in the Thanvan Cave prokaryotic community. A comparison of microbiomes using the Bray–Curtis similarity metric and PCoA analysis revealed a distinct composition of the Pygmy Cave community and a pronounced similarity between all soloid microbiomes and leaf litter microbial assemblages, suggesting microbial input from the surface by air and water currents. The cluster analysis revealed the division of microbial communities into three groups reflecting the characteristics of their ecotopes. The obtained data on the high phylogenetic diversity and taxonomic richness of the cultivated bacterial complexes of soloids demonstrate their possible role as a prokaryotic depository and a potential source of biotechnologically valuable strains.
