Выпуск №53 Сентябрь 2025

1. Генетические варианты TYK2 как предикторы тяжелой формы COVID-19
   Милютина Н. П. Иванова Е. С. Шкурат Т. П.
   Резюме Abstract | Скачать
   575.174.015.3

   В обзоре обобщены представления о роли вариантов гена TYK2 в развитии критического фенотипа COVID-19 - тяжелой формы заболевания. Рассмотрена роль тирозинкиназы 2 в функционировании сигнального пути JAK-STAT и дана молекулярная характеристика фермента. Показано, что миссенс-варианты гена TYK2 - rs12720356-С, rs2304255-Т, rs2304256-А, rs34536443-С, rs35018800-А, связанные с важнейшими доменами фермента - киназным, псевдокиназным и FERM, - ассоциированы с развитием тяжелой формы COVID-19. Генетические варианты TYK2, локализованные в интронных и некодирующих областях гена (rs11085727-Т, rs12720270-G, rs12720358-T, rs280500-AG, rs74956615-A) также ассоциированы с тяжелой формой коронавирусной болезни. Напротив, полиморфные локусы rs280519-AG и rs8108236-АА ассоциированы с пониженным риском развития тяжелой формы COVID-19.

   10.18522/2308-9709-2025-53-5

   The review summarizes the ideas about the role of TYK2 gene variability in the development of the critical phenotype of COVID-19 - a severe form of the disease. The role of tyrosine kinase 2 in the functioning of the JAK-STAT signaling pathway is considered and the molecular characteristics of the enzyme are given. It is shown that missense variants of the TYK2 gene - rs12720356-C, rs2304255-T, rs2304256-A, rs34536443-C, rs35018800-A, associated with the most important domains of the enzyme - kinase, pseudokinase and FERM - are associated with the development of a severe form of COVID-19. TYK2 polymorphisms localized in the intronic and non-coding regions of the gene (rs11085727-T, rs12720270-G, rs12720358-T, rs280500-AG, rs74956615-A) are also associated with a severe form of coronavirus disease. In contrast, rs280519-AG and rs8108236-AA polymorphisms are associated with a reduced risk of developing a severe form of COVID-19.
2. Анализ ассоциации полиморфизма гена ATP8A1 с патозооспермией
   Яровая Е. В. Шерчкова Т. А. Машкина Е. В.
   Резюме Abstract | Скачать
   575.224.22

   В качестве возможных генетических причин формирования патозооспермии можно рассматривать полиморфизм генов, белковые продукты которых вовлечены в процессы сперматогенеза, формирования функционально зрелой структуры сперматозоидов. Важной особенностью функционально активных клеток является асимметричность липидного бислоя клеточных мембран. Флиппаза ATP8A1 ответственна за перемещение фосфатидилсерина во внутренний липидный слой. Появление фосфатидилсерина во внешнем слое является одним из маркеров апоптоза. Целью работы было изучить ассоциацию rs2290870 гена ATP8A1 с развитием патозооспермии у мужчин. Материалом для исследования послужили образцы ДНК, выделенные из эякулята 143 неродственных мужчин репродуктивного возраста. По результатам спермиологического анализа образцы эякулята были разделены на 3 группы: нормозооспермия, тератозооспермия, олигоастенотератозооспермия. Показано, что в группе с нормозооспермией у мужчин, гетерозиготных по rs2290870 гена ATP8A1, статистически значимо снижена доля сперматозоидов с быстрым поступательным движением. Подобная закономерность выявлена и для группы с олигоастенотератозооспермией. Мужчины с олигоастенотератозооспермией, гетерозиготные по rs2290870 гена ATP8A1, характеризуются и наименьшим числом сперматозоидов с нормальной морфологией. Для них же характерна и наименьшая частота жизнеспособных сперматозоидов.

   10.18522/2308-9709-2025-53-4

   Polymorphisms in genes whose protein products are involved in spermatogenesis, the structure of functionally mature spermatozoa formation, can be considered as possible genetic causes of pathozoospermia. An important feature of functionally active cells is the asymmetry of the lipid bilayer of cell membranes. Flippase ATP8A1 is responsible for the translocation of phosphatidylserine to the inner lipid bilayer. The appearance of phosphatidylserine in the outer layer is one of the markers of apoptosis. The aim of this study was to investigate the association of rs2290870 of the ATP8A1 gene with the development of pathozoospermia in men. DNA was isolated from the ejaculate of 143 unrelated men of reproductive age. Based on the results of spermiological analysis, the samples were divided into three groups: normozoospermia, teratozoospermia, and oligoasthenoteratozoospermia. It was shown that in the normozoospermia group, men heterozygous for rs2290870 of the ATP8A1 gene had a statistically significantly reduced proportion of sperm cells with fast progressive motility. A similar pattern was found for the group with oligoasthenoteratozoospermia. Men with oligoasthenoteratozoospermia, heterozygous for rs2290870 of the ATP8A1 gene, are characterized by the lowest number of spermatozoa with normal morphology. They also have the lowest frequency of viable sperm cells.
3. Исследование содержания и запасов углерода в почвах запечатанных территорий ядра Ростовской агломерации
   Скрипников П. Н. Тагивердиев С. С. Меженков А. А. Горбов С. Н. Безуглова О. С. Сальник Н. В.
   Резюме Abstract | Скачать
   631.417

   В статье представлены результаты исследования и расчета запасов органического углерода почв на запечатанных территориях городов Ростов-на-Дону, Аксай и Батайск. Особое внимание уделено обоснованию мощности слоя почвы, которую необходимо учитывать при расчетах запасов органического углерода. На основе анализа профильного распределения содержания органического вещества в погребенных почвенных горизонтах и сравнения с аналогичными горизонтами зональных черноземов, а также расчета средней глубины залегания почвообразующей породы (197 ± 19 см), установлена нижняя граница для запечатанных почв – 200 см. Данный слой позволяет учитывать весь гумусово-аккумулятивный профиль и получать более полные результаты. Средние значения содержания органического углерода составили 1,70 ± 1,86% и 0,75 ± 0,55% для верхних техногенных и погребенных горизонтов соответственно. Определены удельные запасы (на единицу площади) органического углерода в изученном слое для запечатанных почв Ростовской агломерации в целом. Они составили в среднем 178,18 ± 24,11 т/га. Доля верхних трансформированных горизонтов урбиков (UR) в общем пуле углерода составляет 30–40% (73,13 ± 63,57 т/га). Полученные данные позволяют оценить масштабы запасов органического углерода в урбанизированной среде и их вклад в общий углеродный пул. Результаты исследования могут быть полезны для понимания процессов накопления и трансформации органического углерода в городских условиях, а также для разработки мероприятий по сохранению и восстановлению почвенного органического углерода на урбанизированных территориях.

   10.18522/2308-9709-2025-53-3

   The article presents the results of a study and calculation of soil organic carbon stocks in sealed areas of the cities of Rostov-on-Don, Aksay, and Bataysk. Special attention is given to the justification of the soil layer thickness that should be considered when calculating soil organic carbon stocks. Based on the analysis of soil organic carbon profile distribution in buried soil horizons and their comparison with analogous horizons of zonal Chernozems, as well as on the calculation of the mean depth of the parent material (197 ± 19 cm), the lower boundary for sealed soils was set at 200 cm. This depth makes it possible to account for the entire humus-accumulative profile and obtain more comprehensive results. The mean soil organic carbon content amounted to 1.70 ± 1.86% and 0.75 ± 0.55% for the upper technogenic and buried horizons, respectively. Specific stocks (per unit area) of organic carbon in the studied layer of sealed soils of the Rostov agglomeration averaged 178.18 ± 24.11 t/ha. The contribution of the upper transformed Urbic (UR) horizons to the total carbon pool was estimated at 30–40% (73.13 ± 63.57 t/ha). The obtained data provides an assessment of the scale of organic carbon reserves in urbanized environments and their contribution to the overall carbon pool. The results of the study may be useful for understanding the processes of accumulation and transformation of organic carbon in urban conditions, as well as for developing measures aimed at conserving and restoring soil organic carbon in urbanized areas.
4. Влияние химически модифицированного биочара на морфометрические показатели яровой пшеницы
   Клиндухова Ю. Ю. Калашников Н. Д. Бирюкова О. А.
   Резюме Abstract | Скачать
   631.4

   В статье приведены результаты исследований по изучению влияния химически модифицированного биочара на морфометрические показатели яровой пшеницы в условиях вегетационного опыта. Установлено, что насыщенный суперфосфатом биочар (Б+Рс) проявил синергетический эффект. Его внесение в дозах 60 и 90 кг/га обеспечило увеличение длины побегов на 24,0 и 30,0 % соответственно. В варианте Б+Рс/60 отмечена максимальная длина корней (16,8 см) и их масса (2,25 г), что свидетельствует об усилении доступности фосфора и улучшении условий роста корней. Применение высокой дозы (150 кг д.в./га) нецелесообразно. Внесение немодифицированного биочара показало меньший эффект. Использование биочара, насыщенного суперфосфатом, позволит снизить дозу минеральных удобрений без потери эффективности. Полученные результаты следует оценить в условиях полевого опыта.

   10.18522/2308-9709-2025-53-2

   This paper presents the research results on the effect of chemically modified biochar on the morphometric parameters of spring wheat in a vegetation experiment. It was found that biochar saturated with superphosphate (B+Pс) exhibited a synergistic effect. Its application at rates of 60 and 90 kg/ha resulted in an increase in shoot length by 24.0% and 30.0%, respectively. The B+Pс/60 treatment showed the maximum root length (16.8 cm) and root mass (2.25 g), indicating enhanced phosphorus availability and improved root growth conditions. The application of a high dose (150 kg/ha) was found to be impractical. The use of unmodified biochar showed a lesser effect. The use of superphosphate-saturated biochar will allow for a reduction in mineral fertilizer rates without a loss of efficiency. The obtained results should be evaluated in a field experiment.
5. Гены резистентности к антибиотикам микроорганизмов пробиотических препаратов
   Лановая О. Д. Полиниченко А. Е. Сазыкин И. С. Сазыкина М. А. Ажогина Т. Н.
   Резюме Abstract | Скачать
   579.61; 579.25; 615.076

   На сегодняшний день пробиотические препараты широко применяются в терапевтических целях в качестве средства для восстановления микрофлоры и нормализации функций ЖКТ, а также в косметической и пищевой промышленности. Популярность пробиотиков, в свою очередь, стимулирует масштабные исследования, направленные на выявление потенциальных рисков, уникальных свойств и подтверждение положительного влияния пробиотических штаммов микроорганизмов на организм человека и животных. В данной работе было количественно определено содержание десяти генов антибиотикорезистентности (АРГ) в десяти известных пробиотических препаратах, принадлежащих к разным поколениям. Наше исследование выявило значительное разнообразие АРГ в исследуемых препаратах, что указывает на потенциальный риск горизонтального переноса АРГ от пробиотических бактерий к патогенной микрофлоре. Количество копий АРГ в образцах можно расположить в следующем порядке по убыванию: vanB > blaCTX-M > mphA > sul2 > blaVIM-1 > vanA > tetO > aadA2 > mecA > ermB. Анализ частоты встречаемости АРГ выявил преобладание генов, детерминирующих устойчивость к стрептомицину (aadA2), тетрациклинам (tetO), макролидам (ermB), а также β-лактамным антибиотикам (blaVIM-1). Гены mphA и mecA, детерминирующие устойчивость к макролидам и метициллину соответственно, демонстрировали наименьшую частоту встречаемости, будучи идентифицированными в 60% исследованных пробиотических препаратов. Указанные гены антибиотикорезистентности были идентифицированы во всех исследованных пробиотических препаратах. Повсеместная доступность пробиотиков, реализуемых безрецептурно и применяемых в различных областях промышленности, вызывает опасения относительно потенциальных рисков, связанных с неконтролируемым воздействием на микробиоту человека и животных.

   10.18522/2308-9709-2025-53-1

   Today, probiotic drugs are widely used for therapeutic purposes as treatment and restoration of gastrointestinal health, as well as in cosmetics and food industries. The popularity of probiotics, in turn, stimulates large-scale research aimed at identifying potential risks, unique properties and confirming positive effects of probiotic strains of microorganisms on human and animal body. In this work, content of 10 antibiotic resistance genes (ARG) in 10 probiotic drugs belonging to different generations was quantified. Our study revealed a significant ARGS diversity in the studied drugs, which indicates the risk of ARGS horizontal transfer from probiotic bacteria to pathogenic microflora. The abundance of ARG copies in the samples decreased in the following order: vanB > blaCTX-M > mphA > sul2 > blaVIM-1 > vanA > tetO > aadA2 > mecA > ermB. The analysis of ARG genes frequency revealed the predominance of genes that determine resistance to streptomycin (aadA2), tetracyclines (tetO), macrolides (ermB), as well as β-lactam antibiotics (blaVIM-1). In contrast, the mphA (macrolide resistance) and mecA (methicillin resistance) genes were the least frequent, detected in 60% of the tested probiotics. The listed ARGs were present in all studied probiotic preparations. Widespread availability of over-the-counter probiotics-used across multiple industries-raises concerns about potential risks linked to uncontrolled effects on human and animal microbiota.